Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PEX6Q13608 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PEX6Q13608 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PEX6Q13608 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PEX6Q13608 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PEX6Q13608 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PEX6Q13608 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PEX6Q13608 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PEX6Q13608 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PEX6Q13608 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PEX6Q13608 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PEX6Q13608 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PEX6Q13608 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PEX6Q13608 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PEX6Q13608 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PEX6Q13608 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PEX6Q13608 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PEX6Q13608 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PEX6Q13608 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PEX6Q13608 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PEX6Q13608 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PEX6Q13608 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PEX6Q13608 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PEX6Q13608 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PEX6Q13608 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PEX6Q13608 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PEX6Q13608 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PEX6Q13608 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PEX6Q13608 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PEX6Q13608 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PEX6Q13608 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PEX6Q13608 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PEX6Q13608 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PEX6Q13608 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PEX6Q13608 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PEX6Q13608 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PEX6Q13608 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PEX6Q13608 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PEX6Q13608 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PEX6Q13608 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PEX6Q13608 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PEX6Q13608 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PEX6Q13608 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PEX6Q13608 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PEX6Q13608 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PEX6Q13608 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PEX6Q13608 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PEX6Q13608 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PEX6Q13608 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PEX6Q13608 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PEX6Q13608 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PEX6Q13608 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PEX6Q13608 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PEX6Q13608 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PEX6Q13608 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PEX6Q13608 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PEX6Q13608 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PEX6Q13608 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PEX6Q13608 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PEX6Q13608 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PEX6Q13608 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PEX6Q13608 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PEX6Q13608 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PEX6Q13608 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PEX6Q13608 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PEX6Q13608 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PEX6Q13608 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PEX6Q13608 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PEX6Q13608 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PEX6Q13608 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PEX6Q13608 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PEX6Q13608 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PEX6Q13608 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PEX6Q13608 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PEX6Q13608 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PEX6Q13608 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PEX6Q13608 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PEX6Q13608 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PEX6Q13608 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PEX6Q13608 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PEX6Q13608 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PEX6Q13608 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PEX6Q13608 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PEX6Q13608 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PEX6Q13608 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PEX6Q13608 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PEX6Q13608 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PEX6Q13608 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PEX6Q13608 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PEX6Q13608 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PEX6Q13608 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PEX6Q13608 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PEX6Q13608 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PEX6Q13608 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PEX6Q13608 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PEX6Q13608 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PEX6Q13608 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PEX6Q13608 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PEX6Q13608 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PEX6Q13608 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
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