Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
NEUROD1Q13562 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
NEUROD1Q13562 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
NEUROD1Q13562 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
NEUROD1Q13562 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
NEUROD1Q13562 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
NEUROD1Q13562 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
NEUROD1Q13562 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
NEUROD1Q13562 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
NEUROD1Q13562 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
NEUROD1Q13562 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
NEUROD1Q13562 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
NEUROD1Q13562 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
NEUROD1Q13562 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
NEUROD1Q13562 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
NEUROD1Q13562 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
NEUROD1Q13562 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
NEUROD1Q13562 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
NEUROD1Q13562 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
NEUROD1Q13562 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
NEUROD1Q13562 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
NEUROD1Q13562 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
NEUROD1Q13562 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
NEUROD1Q13562 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
NEUROD1Q13562 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
NEUROD1Q13562 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
NEUROD1Q13562 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
NEUROD1Q13562 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
NEUROD1Q13562 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
NEUROD1Q13562 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
NEUROD1Q13562 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
NEUROD1Q13562 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
NEUROD1Q13562 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
NEUROD1Q13562 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
NEUROD1Q13562 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
NEUROD1Q13562 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
NEUROD1Q13562 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
NEUROD1Q13562 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
NEUROD1Q13562 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
NEUROD1Q13562 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC38.89■■■■□ 3.82
NEUROD1Q13562 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC38.89■■■■□ 3.82
NEUROD1Q13562 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
NEUROD1Q13562 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC38.88■■■■□ 3.82
NEUROD1Q13562 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
NEUROD1Q13562 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
NEUROD1Q13562 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC38.88■■■■□ 3.81
NEUROD1Q13562 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
NEUROD1Q13562 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
NEUROD1Q13562 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
NEUROD1Q13562 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
NEUROD1Q13562 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
NEUROD1Q13562 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
NEUROD1Q13562 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
NEUROD1Q13562 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
NEUROD1Q13562 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
NEUROD1Q13562 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
NEUROD1Q13562 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC38.83■■■■□ 3.81
NEUROD1Q13562 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
NEUROD1Q13562 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
NEUROD1Q13562 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
NEUROD1Q13562 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
NEUROD1Q13562 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC38.8■■■■□ 3.8
NEUROD1Q13562 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
NEUROD1Q13562 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
NEUROD1Q13562 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
NEUROD1Q13562 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC38.79■■■■□ 3.8
NEUROD1Q13562 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
NEUROD1Q13562 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
NEUROD1Q13562 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
NEUROD1Q13562 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
NEUROD1Q13562 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
NEUROD1Q13562 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
NEUROD1Q13562 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
NEUROD1Q13562 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
NEUROD1Q13562 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
NEUROD1Q13562 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
NEUROD1Q13562 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
NEUROD1Q13562 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
NEUROD1Q13562 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
NEUROD1Q13562 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
NEUROD1Q13562 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
NEUROD1Q13562 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
NEUROD1Q13562 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC38.71■■■■□ 3.79
NEUROD1Q13562 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
NEUROD1Q13562 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
NEUROD1Q13562 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
NEUROD1Q13562 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
NEUROD1Q13562 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
NEUROD1Q13562 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC38.68■■■■□ 3.78
NEUROD1Q13562 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
NEUROD1Q13562 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
NEUROD1Q13562 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
NEUROD1Q13562 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
NEUROD1Q13562 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
NEUROD1Q13562 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
NEUROD1Q13562 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
NEUROD1Q13562 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
NEUROD1Q13562 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
NEUROD1Q13562 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
NEUROD1Q13562 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms