Protein–RNA interactions for Protein: Q12934

BFSP1, Filensin, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP1Q12934 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
BFSP1Q12934 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
BFSP1Q12934 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BFSP1Q12934 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
BFSP1Q12934 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BFSP1Q12934 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BFSP1Q12934 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BFSP1Q12934 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BFSP1Q12934 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BFSP1Q12934 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BFSP1Q12934 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BFSP1Q12934 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BFSP1Q12934 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BFSP1Q12934 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BFSP1Q12934 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BFSP1Q12934 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BFSP1Q12934 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BFSP1Q12934 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BFSP1Q12934 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BFSP1Q12934 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BFSP1Q12934 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BFSP1Q12934 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BFSP1Q12934 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
BFSP1Q12934 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
BFSP1Q12934 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BFSP1Q12934 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BFSP1Q12934 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BFSP1Q12934 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
BFSP1Q12934 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
BFSP1Q12934 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BFSP1Q12934 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BFSP1Q12934 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
BFSP1Q12934 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BFSP1Q12934 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
BFSP1Q12934 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BFSP1Q12934 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BFSP1Q12934 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BFSP1Q12934 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
BFSP1Q12934 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
BFSP1Q12934 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
BFSP1Q12934 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BFSP1Q12934 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BFSP1Q12934 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BFSP1Q12934 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
BFSP1Q12934 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
BFSP1Q12934 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BFSP1Q12934 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BFSP1Q12934 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BFSP1Q12934 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BFSP1Q12934 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BFSP1Q12934 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BFSP1Q12934 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BFSP1Q12934 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BFSP1Q12934 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
BFSP1Q12934 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BFSP1Q12934 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BFSP1Q12934 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
BFSP1Q12934 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
BFSP1Q12934 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BFSP1Q12934 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
BFSP1Q12934 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
BFSP1Q12934 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BFSP1Q12934 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
BFSP1Q12934 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BFSP1Q12934 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BFSP1Q12934 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BFSP1Q12934 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BFSP1Q12934 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BFSP1Q12934 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BFSP1Q12934 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
BFSP1Q12934 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BFSP1Q12934 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BFSP1Q12934 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BFSP1Q12934 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BFSP1Q12934 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BFSP1Q12934 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BFSP1Q12934 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BFSP1Q12934 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BFSP1Q12934 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BFSP1Q12934 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BFSP1Q12934 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BFSP1Q12934 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BFSP1Q12934 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
BFSP1Q12934 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
BFSP1Q12934 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
BFSP1Q12934 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
BFSP1Q12934 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BFSP1Q12934 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BFSP1Q12934 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BFSP1Q12934 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BFSP1Q12934 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BFSP1Q12934 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BFSP1Q12934 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BFSP1Q12934 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
BFSP1Q12934 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BFSP1Q12934 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
BFSP1Q12934 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BFSP1Q12934 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BFSP1Q12934 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BFSP1Q12934 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms