Protein–RNA interactions for Protein: Q12912

LRMP, Lymphoid-restricted membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRMPQ12912 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LRMPQ12912 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRMPQ12912 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRMPQ12912 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRMPQ12912 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRMPQ12912 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRMPQ12912 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LRMPQ12912 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LRMPQ12912 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LRMPQ12912 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LRMPQ12912 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LRMPQ12912 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LRMPQ12912 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LRMPQ12912 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRMPQ12912 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRMPQ12912 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRMPQ12912 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRMPQ12912 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRMPQ12912 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRMPQ12912 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRMPQ12912 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRMPQ12912 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRMPQ12912 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRMPQ12912 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRMPQ12912 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRMPQ12912 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRMPQ12912 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRMPQ12912 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRMPQ12912 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRMPQ12912 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRMPQ12912 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRMPQ12912 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRMPQ12912 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRMPQ12912 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LRMPQ12912 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRMPQ12912 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRMPQ12912 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRMPQ12912 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRMPQ12912 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRMPQ12912 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRMPQ12912 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRMPQ12912 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRMPQ12912 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRMPQ12912 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRMPQ12912 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRMPQ12912 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRMPQ12912 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRMPQ12912 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LRMPQ12912 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LRMPQ12912 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
LRMPQ12912 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRMPQ12912 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRMPQ12912 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRMPQ12912 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LRMPQ12912 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LRMPQ12912 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LRMPQ12912 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LRMPQ12912 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LRMPQ12912 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LRMPQ12912 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LRMPQ12912 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LRMPQ12912 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRMPQ12912 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRMPQ12912 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRMPQ12912 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
LRMPQ12912 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRMPQ12912 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRMPQ12912 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRMPQ12912 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRMPQ12912 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRMPQ12912 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRMPQ12912 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRMPQ12912 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRMPQ12912 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
LRMPQ12912 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRMPQ12912 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRMPQ12912 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRMPQ12912 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRMPQ12912 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRMPQ12912 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRMPQ12912 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRMPQ12912 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRMPQ12912 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRMPQ12912 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRMPQ12912 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LRMPQ12912 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LRMPQ12912 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
LRMPQ12912 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRMPQ12912 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LRMPQ12912 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRMPQ12912 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRMPQ12912 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRMPQ12912 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRMPQ12912 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
LRMPQ12912 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRMPQ12912 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRMPQ12912 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRMPQ12912 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRMPQ12912 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRMPQ12912 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms