Protein–RNA interactions for Protein: Q10713

PMPCA, Mitochondrial-processing peptidase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMPCAQ10713 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PMPCAQ10713 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PMPCAQ10713 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PMPCAQ10713 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PMPCAQ10713 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PMPCAQ10713 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PMPCAQ10713 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PMPCAQ10713 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PMPCAQ10713 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PMPCAQ10713 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PMPCAQ10713 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PMPCAQ10713 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PMPCAQ10713 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PMPCAQ10713 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PMPCAQ10713 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PMPCAQ10713 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PMPCAQ10713 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PMPCAQ10713 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMPCAQ10713 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMPCAQ10713 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PMPCAQ10713 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PMPCAQ10713 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PMPCAQ10713 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PMPCAQ10713 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PMPCAQ10713 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PMPCAQ10713 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PMPCAQ10713 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PMPCAQ10713 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PMPCAQ10713 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PMPCAQ10713 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PMPCAQ10713 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PMPCAQ10713 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PMPCAQ10713 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PMPCAQ10713 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PMPCAQ10713 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PMPCAQ10713 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PMPCAQ10713 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PMPCAQ10713 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PMPCAQ10713 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PMPCAQ10713 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PMPCAQ10713 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PMPCAQ10713 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PMPCAQ10713 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PMPCAQ10713 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PMPCAQ10713 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PMPCAQ10713 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PMPCAQ10713 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PMPCAQ10713 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PMPCAQ10713 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PMPCAQ10713 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PMPCAQ10713 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PMPCAQ10713 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PMPCAQ10713 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PMPCAQ10713 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PMPCAQ10713 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PMPCAQ10713 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PMPCAQ10713 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PMPCAQ10713 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PMPCAQ10713 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PMPCAQ10713 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PMPCAQ10713 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PMPCAQ10713 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PMPCAQ10713 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PMPCAQ10713 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PMPCAQ10713 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PMPCAQ10713 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PMPCAQ10713 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PMPCAQ10713 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PMPCAQ10713 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PMPCAQ10713 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PMPCAQ10713 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PMPCAQ10713 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PMPCAQ10713 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PMPCAQ10713 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PMPCAQ10713 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PMPCAQ10713 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PMPCAQ10713 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PMPCAQ10713 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PMPCAQ10713 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PMPCAQ10713 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PMPCAQ10713 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PMPCAQ10713 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PMPCAQ10713 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PMPCAQ10713 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PMPCAQ10713 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PMPCAQ10713 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PMPCAQ10713 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PMPCAQ10713 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PMPCAQ10713 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PMPCAQ10713 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PMPCAQ10713 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PMPCAQ10713 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PMPCAQ10713 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PMPCAQ10713 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PMPCAQ10713 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PMPCAQ10713 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PMPCAQ10713 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PMPCAQ10713 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PMPCAQ10713 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PMPCAQ10713 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7 ms