Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NIPAL4Q0D2K0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NIPAL4Q0D2K0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NIPAL4Q0D2K0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NIPAL4Q0D2K0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NIPAL4Q0D2K0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NIPAL4Q0D2K0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NIPAL4Q0D2K0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NIPAL4Q0D2K0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NIPAL4Q0D2K0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NIPAL4Q0D2K0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NIPAL4Q0D2K0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NIPAL4Q0D2K0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NIPAL4Q0D2K0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NIPAL4Q0D2K0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NIPAL4Q0D2K0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NIPAL4Q0D2K0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NIPAL4Q0D2K0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NIPAL4Q0D2K0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NIPAL4Q0D2K0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NIPAL4Q0D2K0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NIPAL4Q0D2K0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NIPAL4Q0D2K0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NIPAL4Q0D2K0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NIPAL4Q0D2K0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NIPAL4Q0D2K0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NIPAL4Q0D2K0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NIPAL4Q0D2K0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NIPAL4Q0D2K0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NIPAL4Q0D2K0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NIPAL4Q0D2K0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NIPAL4Q0D2K0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NIPAL4Q0D2K0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NIPAL4Q0D2K0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NIPAL4Q0D2K0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NIPAL4Q0D2K0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NIPAL4Q0D2K0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NIPAL4Q0D2K0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NIPAL4Q0D2K0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NIPAL4Q0D2K0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NIPAL4Q0D2K0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NIPAL4Q0D2K0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NIPAL4Q0D2K0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NIPAL4Q0D2K0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
NIPAL4Q0D2K0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NIPAL4Q0D2K0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NIPAL4Q0D2K0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NIPAL4Q0D2K0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NIPAL4Q0D2K0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NIPAL4Q0D2K0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NIPAL4Q0D2K0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NIPAL4Q0D2K0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NIPAL4Q0D2K0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NIPAL4Q0D2K0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NIPAL4Q0D2K0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NIPAL4Q0D2K0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NIPAL4Q0D2K0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NIPAL4Q0D2K0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NIPAL4Q0D2K0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NIPAL4Q0D2K0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NIPAL4Q0D2K0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NIPAL4Q0D2K0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NIPAL4Q0D2K0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NIPAL4Q0D2K0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NIPAL4Q0D2K0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NIPAL4Q0D2K0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NIPAL4Q0D2K0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NIPAL4Q0D2K0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NIPAL4Q0D2K0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NIPAL4Q0D2K0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NIPAL4Q0D2K0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NIPAL4Q0D2K0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NIPAL4Q0D2K0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NIPAL4Q0D2K0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NIPAL4Q0D2K0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NIPAL4Q0D2K0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NIPAL4Q0D2K0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NIPAL4Q0D2K0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NIPAL4Q0D2K0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NIPAL4Q0D2K0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NIPAL4Q0D2K0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NIPAL4Q0D2K0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NIPAL4Q0D2K0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NIPAL4Q0D2K0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NIPAL4Q0D2K0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NIPAL4Q0D2K0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NIPAL4Q0D2K0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NIPAL4Q0D2K0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NIPAL4Q0D2K0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NIPAL4Q0D2K0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NIPAL4Q0D2K0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NIPAL4Q0D2K0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NIPAL4Q0D2K0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NIPAL4Q0D2K0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NIPAL4Q0D2K0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NIPAL4Q0D2K0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NIPAL4Q0D2K0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NIPAL4Q0D2K0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NIPAL4Q0D2K0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NIPAL4Q0D2K0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms