Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LTBQ06643 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LTBQ06643 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LTBQ06643 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LTBQ06643 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LTBQ06643 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LTBQ06643 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LTBQ06643 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LTBQ06643 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LTBQ06643 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LTBQ06643 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LTBQ06643 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LTBQ06643 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LTBQ06643 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LTBQ06643 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LTBQ06643 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LTBQ06643 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LTBQ06643 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LTBQ06643 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LTBQ06643 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LTBQ06643 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LTBQ06643 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LTBQ06643 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LTBQ06643 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LTBQ06643 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LTBQ06643 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LTBQ06643 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTBQ06643 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTBQ06643 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTBQ06643 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTBQ06643 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTBQ06643 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LTBQ06643 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LTBQ06643 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LTBQ06643 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LTBQ06643 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LTBQ06643 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LTBQ06643 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LTBQ06643 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LTBQ06643 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LTBQ06643 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LTBQ06643 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LTBQ06643 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LTBQ06643 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LTBQ06643 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LTBQ06643 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LTBQ06643 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LTBQ06643 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LTBQ06643 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LTBQ06643 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LTBQ06643 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LTBQ06643 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LTBQ06643 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LTBQ06643 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LTBQ06643 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LTBQ06643 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LTBQ06643 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LTBQ06643 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LTBQ06643 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LTBQ06643 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LTBQ06643 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LTBQ06643 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LTBQ06643 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LTBQ06643 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LTBQ06643 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LTBQ06643 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LTBQ06643 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LTBQ06643 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LTBQ06643 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LTBQ06643 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LTBQ06643 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LTBQ06643 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LTBQ06643 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LTBQ06643 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LTBQ06643 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LTBQ06643 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LTBQ06643 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LTBQ06643 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LTBQ06643 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LTBQ06643 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LTBQ06643 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LTBQ06643 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LTBQ06643 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LTBQ06643 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LTBQ06643 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LTBQ06643 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LTBQ06643 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LTBQ06643 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LTBQ06643 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LTBQ06643 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LTBQ06643 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LTBQ06643 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LTBQ06643 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LTBQ06643 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LTBQ06643 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LTBQ06643 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LTBQ06643 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LTBQ06643 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LTBQ06643 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LTBQ06643 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms