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Protein–RNA interactions for Protein: Q03048
COF1, Cofilin, yeast
Known RBP
Predictions only
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143 aa
.
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
COF1
Q03048
tD(GUC)L1
tD(GUC)L1
72 nt
6.41
□□□□□ -1.38
COF1
Q03048
tD(GUC)L2
tD(GUC)L2
72 nt
6.41
□□□□□ -1.38
COF1
Q03048
tD(GUC)M
tD(GUC)M
72 nt
6.41
□□□□□ -1.38
COF1
Q03048
tD(GUC)O
tD(GUC)O
72 nt
6.41
□□□□□ -1.38
COF1
Q03048
PHO23
YNL097C
993 nt
6.41
□□□□□ -1.38
COF1
Q03048
AGP3
YFL055W
1677 nt
6.4
□□□□□ -1.38
COF1
Q03048
NDE1
YMR145C
1683 nt
6.4
□□□□□ -1.38
COF1
Q03048
CWP2
YKL096W-A
279 nt
6.4
□□□□□ -1.38
COF1
Q03048
SBA1
YKL117W
651 nt
6.4
□□□□□ -1.38
COF1
Q03048
SHB17
YKR043C
816 nt
6.4
□□□□□ -1.38
COF1
Q03048
LSR1
LSR1
1175 nt
6.4
□□□□□ -1.38
COF1
Q03048
NBP35
YGL091C
987 nt
6.39
□□□□□ -1.39
COF1
Q03048
LAS17
YOR181W
1902 nt
6.38
□□□□□ -1.39
COF1
Q03048
RTG1
YOL067C
534 nt
6.38
□□□□□ -1.39
COF1
Q03048
SHY1
YGR112W
1170 nt
6.37
□□□□□ -1.39
COF1
Q03048
YPR064W
YPR064W
420 nt
6.37
□□□□□ -1.39
COF1
Q03048
DBP1
YPL119C
1854 nt
6.36
□□□□□ -1.39
COF1
Q03048
MRP20
YDR405W
792 nt
6.36
□□□□□ -1.39
COF1
Q03048
HXT1
YHR094C
1713 nt
6.35
□□□□□ -1.39
COF1
Q03048
GND1
YHR183W
1470 nt
6.34
□□□□□ -1.39
COF1
Q03048
POP2
YNR052C
1302 nt
6.34
□□□□□ -1.39
COF1
Q03048
YCR102C
YCR102C
1107 nt
6.34
□□□□□ -1.39
COF1
Q03048
PTH1
YHR189W
573 nt
6.34
□□□□□ -1.39
COF1
Q03048
SHM2
YLR058C
1410 nt
6.33
□□□□□ -1.4
COF1
Q03048
DUS3
YLR401C
2007 nt
6.33
□□□□□ -1.4
COF1
Q03048
GID8
YMR135C
1368 nt
6.33
□□□□□ -1.4
COF1
Q03048
DIG1
YPL049C
1359 nt
6.33
□□□□□ -1.4
COF1
Q03048
MET1
YKR069W
1782 nt
6.32
□□□□□ -1.4
COF1
Q03048
LSC2
YGR244C
1284 nt
6.32
□□□□□ -1.4
COF1
Q03048
BEM1
YBR200W
1656 nt
6.32
□□□□□ -1.4
COF1
Q03048
FRT1
YOR324C
1809 nt
6.32
□□□□□ -1.4
COF1
Q03048
ADE16
YLR028C
1776 nt
6.31
□□□□□ -1.4
COF1
Q03048
CMK2
YOL016C
1344 nt
6.31
□□□□□ -1.4
COF1
Q03048
CCR4
YAL021C
2514 nt
6.31
□□□□□ -1.4
COF1
Q03048
URA6
YKL024C
615 nt
6.31
□□□□□ -1.4
COF1
Q03048
SAM2
YDR502C
1155 nt
6.3
□□□□□ -1.4
COF1
Q03048
VPS62
YGR141W
1404 nt
6.3
□□□□□ -1.4
COF1
Q03048
YKL133C
YKL133C
1392 nt
6.3
□□□□□ -1.4
COF1
Q03048
MRS6
YOR370C
1812 nt
6.29
□□□□□ -1.4
COF1
Q03048
MTG2
YHR168W
1557 nt
6.29
□□□□□ -1.4
COF1
Q03048
NIT1
YIL164C
600 nt
6.29
□□□□□ -1.4
COF1
Q03048
TIM17
YJL143W
477 nt
6.29
□□□□□ -1.4
COF1
Q03048
YKL030W
YKL030W
606 nt
6.29
□□□□□ -1.4
COF1
Q03048
PMA2
YPL036W
2844 nt
6.28
□□□□□ -1.4
COF1
Q03048
BDH1
YAL060W
1149 nt
6.28
□□□□□ -1.4
COF1
Q03048
ORT1
YOR130C
879 nt
6.27
□□□□□ -1.41
COF1
Q03048
GGC1
YDL198C
903 nt
6.26
□□□□□ -1.41
COF1
Q03048
YLR415C
YLR415C
339 nt
6.26
□□□□□ -1.41
COF1
Q03048
LSM5
YER146W
282 nt
6.25
□□□□□ -1.41
COF1
Q03048
HXT12
YIL170W
1374 nt
6.25
□□□□□ -1.41
COF1
Q03048
FET5
YFL041W
1869 nt
6.24
□□□□□ -1.41
COF1
Q03048
INH1
YDL181W
258 nt
6.24
□□□□□ -1.41
COF1
Q03048
TIR3
YIL011W
810 nt
6.24
□□□□□ -1.41
COF1
Q03048
YMR262W
YMR262W
942 nt
6.24
□□□□□ -1.41
COF1
Q03048
PFS2
YNL317W
1398 nt
6.23
□□□□□ -1.41
COF1
Q03048
YDL086W
YDL086W
822 nt
6.23
□□□□□ -1.41
COF1
Q03048
TIM44
YIL022W
1296 nt
6.23
□□□□□ -1.41
COF1
Q03048
FLR1
YBR008C
1647 nt
6.22
□□□□□ -1.41
COF1
Q03048
AIM34
YMR003W
597 nt
6.22
□□□□□ -1.41
COF1
Q03048
ZTA1
YBR046C
1005 nt
6.22
□□□□□ -1.41
COF1
Q03048
BAP3
YDR046C
1815 nt
6.21
□□□□□ -1.42
COF1
Q03048
TOP3
YLR234W
1971 nt
6.21
□□□□□ -1.42
COF1
Q03048
ECM27
YJR106W
2178 nt
6.21
□□□□□ -1.42
COF1
Q03048
CTF3
YLR381W
2202 nt
6.21
□□□□□ -1.42
COF1
Q03048
YHR219W
YHR219W
1875 nt
6.2
□□□□□ -1.42
COF1
Q03048
HEL1
YKR017C
1656 nt
6.2
□□□□□ -1.42
COF1
Q03048
ACH1
YBL015W
1581 nt
6.19
□□□□□ -1.42
COF1
Q03048
ITR1
YDR497C
1755 nt
6.19
□□□□□ -1.42
COF1
Q03048
PET8
YNL003C
855 nt
6.19
□□□□□ -1.42
COF1
Q03048
SGT2
YOR007C
1041 nt
6.19
□□□□□ -1.42
COF1
Q03048
snR4
snR4
186 nt
6.19
□□□□□ -1.42
COF1
Q03048
RPD3
YNL330C
1302 nt
6.18
□□□□□ -1.42
COF1
Q03048
SMC5
YOL034W
3282 nt
6.17
□□□□□ -1.42
COF1
Q03048
YNL115C
YNL115C
1935 nt
6.17
□□□□□ -1.42
COF1
Q03048
CKI1
YLR133W
1749 nt
6.17
□□□□□ -1.42
COF1
Q03048
KRR1
YCL059C
951 nt
6.17
□□□□□ -1.42
COF1
Q03048
SLM3
YDL033C
1254 nt
6.17
□□□□□ -1.42
COF1
Q03048
DIF1
YLR437C
402 nt
6.17
□□□□□ -1.42
COF1
Q03048
AAC3
YBR085W
924 nt
6.17
□□□□□ -1.42
COF1
Q03048
CRN1
YLR429W
1956 nt
6.17
□□□□□ -1.42
COF1
Q03048
YSP3
YOR003W
1437 nt
6.16
□□□□□ -1.42
COF1
Q03048
UFO1
YML088W
2007 nt
6.16
□□□□□ -1.42
COF1
Q03048
YML089C
YML089C
369 nt
6.15
□□□□□ -1.42
COF1
Q03048
ADH6
YMR318C
1083 nt
6.15
□□□□□ -1.42
COF1
Q03048
YBL086C
YBL086C
1401 nt
6.15
□□□□□ -1.43
COF1
Q03048
POM34
YLR018C
900 nt
6.14
□□□□□ -1.43
COF1
Q03048
ATP10
YLR393W
840 nt
6.14
□□□□□ -1.43
COF1
Q03048
SPP1
YPL138C
1062 nt
6.14
□□□□□ -1.43
COF1
Q03048
RIM2
YBR192W
1134 nt
6.14
□□□□□ -1.43
COF1
Q03048
HSV2
YGR223C
1347 nt
6.14
□□□□□ -1.43
COF1
Q03048
PRO1
YDR300C
1287 nt
6.13
□□□□□ -1.43
COF1
Q03048
SPP2
YOR148C
558 nt
6.13
□□□□□ -1.43
COF1
Q03048
OYE3
YPL171C
1203 nt
6.13
□□□□□ -1.43
COF1
Q03048
YIL108W
YIL108W
2091 nt
6.13
□□□□□ -1.43
COF1
Q03048
DIA4
YHR011W
1341 nt
6.12
□□□□□ -1.43
COF1
Q03048
DAL7
YIR031C
1665 nt
6.11
□□□□□ -1.43
COF1
Q03048
tL(GAG)G
tL(GAG)G
82 nt
6.11
□□□□□ -1.43
COF1
Q03048
AFG2
YLR397C
2343 nt
6.11
□□□□□ -1.43
COF1
Q03048
MSB3
YNL293W
1902 nt
6.11
□□□□□ -1.43
COF1
Q03048
YCR061W
YCR061W
1896 nt
6.11
□□□□□ -1.43
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