Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MS4A2Q01362 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MS4A2Q01362 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MS4A2Q01362 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MS4A2Q01362 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MS4A2Q01362 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MS4A2Q01362 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MS4A2Q01362 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MS4A2Q01362 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MS4A2Q01362 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MS4A2Q01362 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MS4A2Q01362 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MS4A2Q01362 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MS4A2Q01362 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MS4A2Q01362 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MS4A2Q01362 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MS4A2Q01362 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MS4A2Q01362 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MS4A2Q01362 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MS4A2Q01362 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MS4A2Q01362 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MS4A2Q01362 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MS4A2Q01362 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MS4A2Q01362 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MS4A2Q01362 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MS4A2Q01362 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MS4A2Q01362 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MS4A2Q01362 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MS4A2Q01362 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MS4A2Q01362 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MS4A2Q01362 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MS4A2Q01362 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MS4A2Q01362 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MS4A2Q01362 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MS4A2Q01362 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MS4A2Q01362 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MS4A2Q01362 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MS4A2Q01362 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MS4A2Q01362 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MS4A2Q01362 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MS4A2Q01362 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MS4A2Q01362 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MS4A2Q01362 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MS4A2Q01362 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MS4A2Q01362 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MS4A2Q01362 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MS4A2Q01362 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MS4A2Q01362 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MS4A2Q01362 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MS4A2Q01362 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MS4A2Q01362 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MS4A2Q01362 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MS4A2Q01362 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MS4A2Q01362 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MS4A2Q01362 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MS4A2Q01362 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MS4A2Q01362 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MS4A2Q01362 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MS4A2Q01362 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MS4A2Q01362 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MS4A2Q01362 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MS4A2Q01362 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MS4A2Q01362 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MS4A2Q01362 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MS4A2Q01362 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MS4A2Q01362 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MS4A2Q01362 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MS4A2Q01362 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MS4A2Q01362 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MS4A2Q01362 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MS4A2Q01362 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MS4A2Q01362 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MS4A2Q01362 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MS4A2Q01362 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MS4A2Q01362 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MS4A2Q01362 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MS4A2Q01362 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MS4A2Q01362 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MS4A2Q01362 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MS4A2Q01362 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MS4A2Q01362 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MS4A2Q01362 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MS4A2Q01362 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MS4A2Q01362 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MS4A2Q01362 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MS4A2Q01362 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MS4A2Q01362 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MS4A2Q01362 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MS4A2Q01362 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MS4A2Q01362 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MS4A2Q01362 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MS4A2Q01362 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MS4A2Q01362 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MS4A2Q01362 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MS4A2Q01362 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MS4A2Q01362 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MS4A2Q01362 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MS4A2Q01362 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MS4A2Q01362 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MS4A2Q01362 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms