Protein–RNA interactions for Protein: Q00653

NFKB2, Nuclear factor NF-kappa-B p100 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB2Q00653 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NFKB2Q00653 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NFKB2Q00653 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NFKB2Q00653 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NFKB2Q00653 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NFKB2Q00653 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NFKB2Q00653 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NFKB2Q00653 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NFKB2Q00653 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NFKB2Q00653 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NFKB2Q00653 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NFKB2Q00653 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NFKB2Q00653 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NFKB2Q00653 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NFKB2Q00653 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NFKB2Q00653 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NFKB2Q00653 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NFKB2Q00653 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NFKB2Q00653 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NFKB2Q00653 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NFKB2Q00653 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NFKB2Q00653 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NFKB2Q00653 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NFKB2Q00653 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NFKB2Q00653 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NFKB2Q00653 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NFKB2Q00653 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NFKB2Q00653 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NFKB2Q00653 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NFKB2Q00653 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NFKB2Q00653 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NFKB2Q00653 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NFKB2Q00653 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NFKB2Q00653 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
NFKB2Q00653 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NFKB2Q00653 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NFKB2Q00653 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NFKB2Q00653 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NFKB2Q00653 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NFKB2Q00653 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
NFKB2Q00653 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NFKB2Q00653 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NFKB2Q00653 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NFKB2Q00653 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NFKB2Q00653 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NFKB2Q00653 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NFKB2Q00653 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NFKB2Q00653 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NFKB2Q00653 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NFKB2Q00653 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NFKB2Q00653 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NFKB2Q00653 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NFKB2Q00653 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NFKB2Q00653 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NFKB2Q00653 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NFKB2Q00653 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NFKB2Q00653 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NFKB2Q00653 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NFKB2Q00653 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NFKB2Q00653 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NFKB2Q00653 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFKB2Q00653 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFKB2Q00653 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NFKB2Q00653 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NFKB2Q00653 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NFKB2Q00653 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFKB2Q00653 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NFKB2Q00653 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NFKB2Q00653 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NFKB2Q00653 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NFKB2Q00653 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NFKB2Q00653 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NFKB2Q00653 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NFKB2Q00653 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NFKB2Q00653 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NFKB2Q00653 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NFKB2Q00653 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFKB2Q00653 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NFKB2Q00653 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NFKB2Q00653 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NFKB2Q00653 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NFKB2Q00653 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NFKB2Q00653 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NFKB2Q00653 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NFKB2Q00653 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NFKB2Q00653 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NFKB2Q00653 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NFKB2Q00653 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NFKB2Q00653 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NFKB2Q00653 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NFKB2Q00653 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NFKB2Q00653 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NFKB2Q00653 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NFKB2Q00653 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NFKB2Q00653 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NFKB2Q00653 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NFKB2Q00653 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NFKB2Q00653 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NFKB2Q00653 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NFKB2Q00653 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms