Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HPCAP84074 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HPCAP84074 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HPCAP84074 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HPCAP84074 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HPCAP84074 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HPCAP84074 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HPCAP84074 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HPCAP84074 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HPCAP84074 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HPCAP84074 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HPCAP84074 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HPCAP84074 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HPCAP84074 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HPCAP84074 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HPCAP84074 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HPCAP84074 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HPCAP84074 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HPCAP84074 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HPCAP84074 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HPCAP84074 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HPCAP84074 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HPCAP84074 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HPCAP84074 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HPCAP84074 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HPCAP84074 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HPCAP84074 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HPCAP84074 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HPCAP84074 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HPCAP84074 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HPCAP84074 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HPCAP84074 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HPCAP84074 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HPCAP84074 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HPCAP84074 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HPCAP84074 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HPCAP84074 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HPCAP84074 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HPCAP84074 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HPCAP84074 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HPCAP84074 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HPCAP84074 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HPCAP84074 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HPCAP84074 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HPCAP84074 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HPCAP84074 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HPCAP84074 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HPCAP84074 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HPCAP84074 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HPCAP84074 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HPCAP84074 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HPCAP84074 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HPCAP84074 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HPCAP84074 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HPCAP84074 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HPCAP84074 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HPCAP84074 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HPCAP84074 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HPCAP84074 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HPCAP84074 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HPCAP84074 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HPCAP84074 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HPCAP84074 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HPCAP84074 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HPCAP84074 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HPCAP84074 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HPCAP84074 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HPCAP84074 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HPCAP84074 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HPCAP84074 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HPCAP84074 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HPCAP84074 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HPCAP84074 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HPCAP84074 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HPCAP84074 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HPCAP84074 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HPCAP84074 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HPCAP84074 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HPCAP84074 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HPCAP84074 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HPCAP84074 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HPCAP84074 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HPCAP84074 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HPCAP84074 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HPCAP84074 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HPCAP84074 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HPCAP84074 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HPCAP84074 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HPCAP84074 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HPCAP84074 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HPCAP84074 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HPCAP84074 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HPCAP84074 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HPCAP84074 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HPCAP84074 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HPCAP84074 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HPCAP84074 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HPCAP84074 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HPCAP84074 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HPCAP84074 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms