Protein–RNA interactions for Protein: P82980

RBP5, Retinol-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP5P82980 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RBP5P82980 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RBP5P82980 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RBP5P82980 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RBP5P82980 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RBP5P82980 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RBP5P82980 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RBP5P82980 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RBP5P82980 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RBP5P82980 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RBP5P82980 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RBP5P82980 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RBP5P82980 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RBP5P82980 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RBP5P82980 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RBP5P82980 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RBP5P82980 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RBP5P82980 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RBP5P82980 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RBP5P82980 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RBP5P82980 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RBP5P82980 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RBP5P82980 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RBP5P82980 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RBP5P82980 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RBP5P82980 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
RBP5P82980 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RBP5P82980 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RBP5P82980 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RBP5P82980 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RBP5P82980 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RBP5P82980 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RBP5P82980 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RBP5P82980 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RBP5P82980 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RBP5P82980 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RBP5P82980 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RBP5P82980 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RBP5P82980 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RBP5P82980 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RBP5P82980 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RBP5P82980 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RBP5P82980 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RBP5P82980 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RBP5P82980 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RBP5P82980 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RBP5P82980 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RBP5P82980 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RBP5P82980 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RBP5P82980 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RBP5P82980 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RBP5P82980 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RBP5P82980 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RBP5P82980 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RBP5P82980 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RBP5P82980 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
RBP5P82980 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RBP5P82980 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RBP5P82980 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RBP5P82980 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RBP5P82980 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RBP5P82980 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RBP5P82980 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RBP5P82980 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RBP5P82980 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RBP5P82980 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RBP5P82980 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RBP5P82980 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RBP5P82980 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RBP5P82980 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RBP5P82980 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RBP5P82980 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RBP5P82980 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RBP5P82980 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RBP5P82980 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RBP5P82980 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RBP5P82980 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RBP5P82980 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RBP5P82980 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RBP5P82980 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RBP5P82980 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RBP5P82980 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RBP5P82980 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RBP5P82980 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RBP5P82980 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RBP5P82980 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RBP5P82980 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RBP5P82980 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RBP5P82980 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RBP5P82980 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RBP5P82980 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RBP5P82980 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RBP5P82980 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RBP5P82980 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RBP5P82980 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RBP5P82980 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RBP5P82980 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RBP5P82980 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RBP5P82980 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
RBP5P82980 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms