Protein–RNA interactions for Protein: P78413

IRX4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX4P78413 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IRX4P78413 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IRX4P78413 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IRX4P78413 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IRX4P78413 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IRX4P78413 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
IRX4P78413 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
IRX4P78413 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IRX4P78413 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IRX4P78413 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IRX4P78413 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IRX4P78413 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IRX4P78413 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IRX4P78413 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IRX4P78413 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IRX4P78413 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
IRX4P78413 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
IRX4P78413 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
IRX4P78413 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IRX4P78413 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
IRX4P78413 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
IRX4P78413 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IRX4P78413 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
IRX4P78413 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
IRX4P78413 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
IRX4P78413 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
IRX4P78413 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IRX4P78413 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IRX4P78413 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IRX4P78413 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IRX4P78413 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
IRX4P78413 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IRX4P78413 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
IRX4P78413 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IRX4P78413 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
IRX4P78413 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
IRX4P78413 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IRX4P78413 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IRX4P78413 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IRX4P78413 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IRX4P78413 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
IRX4P78413 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
IRX4P78413 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IRX4P78413 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IRX4P78413 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IRX4P78413 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IRX4P78413 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
IRX4P78413 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
IRX4P78413 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
IRX4P78413 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
IRX4P78413 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
IRX4P78413 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
IRX4P78413 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
IRX4P78413 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
IRX4P78413 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IRX4P78413 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
IRX4P78413 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
IRX4P78413 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IRX4P78413 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IRX4P78413 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
IRX4P78413 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
IRX4P78413 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
IRX4P78413 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IRX4P78413 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IRX4P78413 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IRX4P78413 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IRX4P78413 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IRX4P78413 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IRX4P78413 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IRX4P78413 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IRX4P78413 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IRX4P78413 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IRX4P78413 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IRX4P78413 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IRX4P78413 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IRX4P78413 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IRX4P78413 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IRX4P78413 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
IRX4P78413 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
IRX4P78413 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
IRX4P78413 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
IRX4P78413 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IRX4P78413 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IRX4P78413 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IRX4P78413 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
IRX4P78413 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IRX4P78413 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
IRX4P78413 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IRX4P78413 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IRX4P78413 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IRX4P78413 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
IRX4P78413 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IRX4P78413 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IRX4P78413 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
IRX4P78413 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IRX4P78413 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IRX4P78413 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
IRX4P78413 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
IRX4P78413 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
IRX4P78413 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms