Protein–RNA interactions for Protein: P78330

PSPH, Phosphoserine phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPHP78330 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSPHP78330 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PSPHP78330 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSPHP78330 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSPHP78330 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSPHP78330 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSPHP78330 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSPHP78330 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSPHP78330 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSPHP78330 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSPHP78330 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSPHP78330 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSPHP78330 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSPHP78330 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSPHP78330 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSPHP78330 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSPHP78330 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSPHP78330 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PSPHP78330 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSPHP78330 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSPHP78330 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSPHP78330 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PSPHP78330 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSPHP78330 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PSPHP78330 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PSPHP78330 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSPHP78330 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSPHP78330 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSPHP78330 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSPHP78330 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSPHP78330 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSPHP78330 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSPHP78330 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSPHP78330 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSPHP78330 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSPHP78330 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSPHP78330 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PSPHP78330 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSPHP78330 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PSPHP78330 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSPHP78330 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSPHP78330 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PSPHP78330 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSPHP78330 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSPHP78330 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSPHP78330 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSPHP78330 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSPHP78330 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSPHP78330 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSPHP78330 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSPHP78330 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSPHP78330 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSPHP78330 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSPHP78330 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSPHP78330 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSPHP78330 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSPHP78330 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSPHP78330 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PSPHP78330 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSPHP78330 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSPHP78330 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSPHP78330 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSPHP78330 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSPHP78330 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSPHP78330 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSPHP78330 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSPHP78330 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSPHP78330 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSPHP78330 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSPHP78330 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSPHP78330 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSPHP78330 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSPHP78330 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSPHP78330 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSPHP78330 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSPHP78330 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PSPHP78330 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSPHP78330 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSPHP78330 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSPHP78330 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PSPHP78330 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSPHP78330 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSPHP78330 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSPHP78330 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSPHP78330 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSPHP78330 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSPHP78330 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSPHP78330 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSPHP78330 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSPHP78330 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSPHP78330 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSPHP78330 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSPHP78330 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSPHP78330 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSPHP78330 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSPHP78330 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSPHP78330 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSPHP78330 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSPHP78330 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSPHP78330 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms