Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SH3BP2P78314 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SH3BP2P78314 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SH3BP2P78314 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SH3BP2P78314 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SH3BP2P78314 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SH3BP2P78314 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SH3BP2P78314 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SH3BP2P78314 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SH3BP2P78314 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SH3BP2P78314 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SH3BP2P78314 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SH3BP2P78314 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SH3BP2P78314 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SH3BP2P78314 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SH3BP2P78314 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SH3BP2P78314 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SH3BP2P78314 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SH3BP2P78314 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SH3BP2P78314 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SH3BP2P78314 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SH3BP2P78314 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SH3BP2P78314 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SH3BP2P78314 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SH3BP2P78314 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SH3BP2P78314 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SH3BP2P78314 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SH3BP2P78314 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SH3BP2P78314 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SH3BP2P78314 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SH3BP2P78314 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SH3BP2P78314 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SH3BP2P78314 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SH3BP2P78314 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SH3BP2P78314 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SH3BP2P78314 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SH3BP2P78314 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SH3BP2P78314 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SH3BP2P78314 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SH3BP2P78314 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SH3BP2P78314 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SH3BP2P78314 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SH3BP2P78314 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SH3BP2P78314 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SH3BP2P78314 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SH3BP2P78314 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SH3BP2P78314 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SH3BP2P78314 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SH3BP2P78314 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SH3BP2P78314 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SH3BP2P78314 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SH3BP2P78314 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SH3BP2P78314 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SH3BP2P78314 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SH3BP2P78314 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SH3BP2P78314 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SH3BP2P78314 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SH3BP2P78314 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SH3BP2P78314 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SH3BP2P78314 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SH3BP2P78314 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SH3BP2P78314 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SH3BP2P78314 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SH3BP2P78314 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SH3BP2P78314 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SH3BP2P78314 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SH3BP2P78314 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SH3BP2P78314 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SH3BP2P78314 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SH3BP2P78314 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SH3BP2P78314 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SH3BP2P78314 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SH3BP2P78314 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SH3BP2P78314 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SH3BP2P78314 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SH3BP2P78314 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SH3BP2P78314 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SH3BP2P78314 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SH3BP2P78314 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SH3BP2P78314 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SH3BP2P78314 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SH3BP2P78314 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SH3BP2P78314 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SH3BP2P78314 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SH3BP2P78314 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SH3BP2P78314 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SH3BP2P78314 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SH3BP2P78314 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SH3BP2P78314 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SH3BP2P78314 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SH3BP2P78314 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SH3BP2P78314 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SH3BP2P78314 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SH3BP2P78314 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SH3BP2P78314 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SH3BP2P78314 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SH3BP2P78314 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SH3BP2P78314 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SH3BP2P78314 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SH3BP2P78314 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms