Protein–RNA interactions for Protein: P62987

UBA52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA52P62987 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBA52P62987 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBA52P62987 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBA52P62987 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBA52P62987 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBA52P62987 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBA52P62987 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
UBA52P62987 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBA52P62987 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBA52P62987 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBA52P62987 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBA52P62987 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBA52P62987 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBA52P62987 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBA52P62987 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBA52P62987 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBA52P62987 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBA52P62987 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBA52P62987 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBA52P62987 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBA52P62987 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBA52P62987 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBA52P62987 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBA52P62987 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBA52P62987 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBA52P62987 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBA52P62987 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBA52P62987 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBA52P62987 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBA52P62987 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBA52P62987 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBA52P62987 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
UBA52P62987 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
UBA52P62987 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBA52P62987 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBA52P62987 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
UBA52P62987 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBA52P62987 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBA52P62987 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBA52P62987 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBA52P62987 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBA52P62987 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBA52P62987 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBA52P62987 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBA52P62987 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBA52P62987 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBA52P62987 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBA52P62987 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBA52P62987 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBA52P62987 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBA52P62987 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBA52P62987 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UBA52P62987 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBA52P62987 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBA52P62987 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBA52P62987 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBA52P62987 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBA52P62987 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBA52P62987 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBA52P62987 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBA52P62987 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBA52P62987 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBA52P62987 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBA52P62987 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBA52P62987 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBA52P62987 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBA52P62987 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBA52P62987 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBA52P62987 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBA52P62987 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBA52P62987 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
UBA52P62987 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBA52P62987 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBA52P62987 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBA52P62987 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBA52P62987 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBA52P62987 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBA52P62987 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBA52P62987 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UBA52P62987 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBA52P62987 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBA52P62987 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBA52P62987 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBA52P62987 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBA52P62987 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBA52P62987 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBA52P62987 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBA52P62987 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBA52P62987 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBA52P62987 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBA52P62987 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBA52P62987 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBA52P62987 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBA52P62987 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBA52P62987 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBA52P62987 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBA52P62987 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBA52P62987 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
UBA52P62987 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBA52P62987 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms