Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GNB1P62873 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GNB1P62873 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GNB1P62873 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GNB1P62873 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GNB1P62873 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GNB1P62873 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GNB1P62873 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GNB1P62873 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GNB1P62873 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GNB1P62873 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GNB1P62873 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GNB1P62873 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GNB1P62873 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GNB1P62873 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GNB1P62873 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GNB1P62873 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GNB1P62873 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GNB1P62873 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GNB1P62873 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GNB1P62873 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GNB1P62873 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GNB1P62873 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GNB1P62873 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GNB1P62873 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GNB1P62873 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GNB1P62873 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GNB1P62873 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GNB1P62873 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GNB1P62873 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GNB1P62873 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GNB1P62873 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GNB1P62873 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GNB1P62873 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GNB1P62873 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GNB1P62873 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GNB1P62873 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GNB1P62873 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GNB1P62873 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GNB1P62873 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GNB1P62873 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GNB1P62873 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GNB1P62873 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GNB1P62873 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GNB1P62873 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GNB1P62873 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GNB1P62873 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GNB1P62873 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GNB1P62873 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GNB1P62873 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GNB1P62873 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GNB1P62873 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GNB1P62873 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GNB1P62873 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GNB1P62873 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GNB1P62873 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GNB1P62873 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GNB1P62873 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GNB1P62873 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GNB1P62873 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
GNB1P62873 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GNB1P62873 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GNB1P62873 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GNB1P62873 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GNB1P62873 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GNB1P62873 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GNB1P62873 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GNB1P62873 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GNB1P62873 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GNB1P62873 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GNB1P62873 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GNB1P62873 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GNB1P62873 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GNB1P62873 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GNB1P62873 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GNB1P62873 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GNB1P62873 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GNB1P62873 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GNB1P62873 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GNB1P62873 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GNB1P62873 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GNB1P62873 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GNB1P62873 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GNB1P62873 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GNB1P62873 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GNB1P62873 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GNB1P62873 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GNB1P62873 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GNB1P62873 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GNB1P62873 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GNB1P62873 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GNB1P62873 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GNB1P62873 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GNB1P62873 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GNB1P62873 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GNB1P62873 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GNB1P62873 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GNB1P62873 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GNB1P62873 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GNB1P62873 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms