Protein–RNA interactions for Protein: P62750

RPL23A, 60S ribosomal protein L23a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23AP62750 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL23AP62750 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL23AP62750 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPL23AP62750 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPL23AP62750 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPL23AP62750 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL23AP62750 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL23AP62750 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL23AP62750 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL23AP62750 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL23AP62750 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL23AP62750 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL23AP62750 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL23AP62750 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL23AP62750 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL23AP62750 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL23AP62750 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL23AP62750 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL23AP62750 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL23AP62750 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL23AP62750 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL23AP62750 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL23AP62750 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL23AP62750 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPL23AP62750 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPL23AP62750 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL23AP62750 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL23AP62750 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL23AP62750 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL23AP62750 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL23AP62750 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL23AP62750 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL23AP62750 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL23AP62750 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPL23AP62750 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPL23AP62750 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPL23AP62750 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPL23AP62750 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPL23AP62750 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RPL23AP62750 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RPL23AP62750 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPL23AP62750 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPL23AP62750 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPL23AP62750 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPL23AP62750 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPL23AP62750 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPL23AP62750 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPL23AP62750 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPL23AP62750 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL23AP62750 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL23AP62750 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL23AP62750 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL23AP62750 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL23AP62750 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL23AP62750 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL23AP62750 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL23AP62750 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL23AP62750 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL23AP62750 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL23AP62750 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPL23AP62750 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPL23AP62750 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL23AP62750 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL23AP62750 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL23AP62750 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL23AP62750 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL23AP62750 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL23AP62750 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL23AP62750 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL23AP62750 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL23AP62750 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL23AP62750 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL23AP62750 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL23AP62750 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL23AP62750 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL23AP62750 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL23AP62750 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL23AP62750 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL23AP62750 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL23AP62750 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL23AP62750 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL23AP62750 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL23AP62750 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL23AP62750 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL23AP62750 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL23AP62750 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL23AP62750 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL23AP62750 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL23AP62750 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL23AP62750 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL23AP62750 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL23AP62750 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL23AP62750 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL23AP62750 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL23AP62750 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL23AP62750 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL23AP62750 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL23AP62750 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL23AP62750 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL23AP62750 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms