Protein–RNA interactions for Protein: P62310

LSM3, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM3P62310 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LSM3P62310 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LSM3P62310 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LSM3P62310 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LSM3P62310 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LSM3P62310 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LSM3P62310 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LSM3P62310 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LSM3P62310 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LSM3P62310 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LSM3P62310 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LSM3P62310 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LSM3P62310 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LSM3P62310 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LSM3P62310 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LSM3P62310 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LSM3P62310 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LSM3P62310 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LSM3P62310 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LSM3P62310 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LSM3P62310 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LSM3P62310 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LSM3P62310 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LSM3P62310 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LSM3P62310 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LSM3P62310 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LSM3P62310 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LSM3P62310 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LSM3P62310 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LSM3P62310 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LSM3P62310 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LSM3P62310 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LSM3P62310 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LSM3P62310 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSM3P62310 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSM3P62310 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSM3P62310 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSM3P62310 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSM3P62310 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSM3P62310 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LSM3P62310 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LSM3P62310 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LSM3P62310 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LSM3P62310 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LSM3P62310 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LSM3P62310 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LSM3P62310 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LSM3P62310 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LSM3P62310 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LSM3P62310 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LSM3P62310 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LSM3P62310 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LSM3P62310 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LSM3P62310 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LSM3P62310 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LSM3P62310 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LSM3P62310 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LSM3P62310 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LSM3P62310 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LSM3P62310 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LSM3P62310 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LSM3P62310 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LSM3P62310 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LSM3P62310 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LSM3P62310 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LSM3P62310 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LSM3P62310 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LSM3P62310 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LSM3P62310 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LSM3P62310 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LSM3P62310 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LSM3P62310 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LSM3P62310 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LSM3P62310 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LSM3P62310 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LSM3P62310 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LSM3P62310 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LSM3P62310 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LSM3P62310 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LSM3P62310 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LSM3P62310 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LSM3P62310 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LSM3P62310 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LSM3P62310 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LSM3P62310 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LSM3P62310 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LSM3P62310 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LSM3P62310 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LSM3P62310 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LSM3P62310 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LSM3P62310 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LSM3P62310 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LSM3P62310 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LSM3P62310 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LSM3P62310 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LSM3P62310 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LSM3P62310 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LSM3P62310 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LSM3P62310 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LSM3P62310 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms