Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPS29P62273 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPS29P62273 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPS29P62273 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPS29P62273 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPS29P62273 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPS29P62273 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPS29P62273 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPS29P62273 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPS29P62273 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPS29P62273 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPS29P62273 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPS29P62273 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPS29P62273 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RPS29P62273 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPS29P62273 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPS29P62273 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPS29P62273 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPS29P62273 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPS29P62273 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPS29P62273 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPS29P62273 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPS29P62273 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPS29P62273 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPS29P62273 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RPS29P62273 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPS29P62273 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPS29P62273 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPS29P62273 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPS29P62273 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RPS29P62273 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPS29P62273 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPS29P62273 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPS29P62273 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS29P62273 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS29P62273 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS29P62273 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS29P62273 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS29P62273 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS29P62273 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS29P62273 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS29P62273 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS29P62273 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS29P62273 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS29P62273 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS29P62273 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS29P62273 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS29P62273 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS29P62273 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS29P62273 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS29P62273 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS29P62273 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS29P62273 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS29P62273 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS29P62273 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPS29P62273 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPS29P62273 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPS29P62273 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPS29P62273 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPS29P62273 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS29P62273 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS29P62273 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS29P62273 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS29P62273 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS29P62273 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS29P62273 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS29P62273 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPS29P62273 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPS29P62273 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPS29P62273 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPS29P62273 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPS29P62273 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPS29P62273 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPS29P62273 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPS29P62273 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPS29P62273 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPS29P62273 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPS29P62273 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPS29P62273 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RPS29P62273 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPS29P62273 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPS29P62273 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPS29P62273 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RPS29P62273 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPS29P62273 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPS29P62273 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RPS29P62273 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPS29P62273 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPS29P62273 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPS29P62273 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPS29P62273 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPS29P62273 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPS29P62273 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RPS29P62273 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RPS29P62273 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPS29P62273 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RPS29P62273 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPS29P62273 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPS29P62273 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPS29P62273 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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