Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERVFC1P60507 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERVFC1P60507 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERVFC1P60507 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ERVFC1P60507 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ERVFC1P60507 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ERVFC1P60507 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ERVFC1P60507 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ERVFC1P60507 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
ERVFC1P60507 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
ERVFC1P60507 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
ERVFC1P60507 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ERVFC1P60507 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ERVFC1P60507 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ERVFC1P60507 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ERVFC1P60507 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ERVFC1P60507 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ERVFC1P60507 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ERVFC1P60507 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ERVFC1P60507 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ERVFC1P60507 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ERVFC1P60507 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ERVFC1P60507 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ERVFC1P60507 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ERVFC1P60507 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ERVFC1P60507 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ERVFC1P60507 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ERVFC1P60507 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ERVFC1P60507 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ERVFC1P60507 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
ERVFC1P60507 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
ERVFC1P60507 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
ERVFC1P60507 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ERVFC1P60507 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ERVFC1P60507 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ERVFC1P60507 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ERVFC1P60507 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ERVFC1P60507 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ERVFC1P60507 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ERVFC1P60507 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ERVFC1P60507 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ERVFC1P60507 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ERVFC1P60507 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ERVFC1P60507 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ERVFC1P60507 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ERVFC1P60507 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
ERVFC1P60507 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ERVFC1P60507 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ERVFC1P60507 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ERVFC1P60507 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ERVFC1P60507 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ERVFC1P60507 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ERVFC1P60507 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ERVFC1P60507 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ERVFC1P60507 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ERVFC1P60507 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ERVFC1P60507 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ERVFC1P60507 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ERVFC1P60507 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ERVFC1P60507 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ERVFC1P60507 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ERVFC1P60507 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ERVFC1P60507 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ERVFC1P60507 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ERVFC1P60507 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ERVFC1P60507 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ERVFC1P60507 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ERVFC1P60507 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ERVFC1P60507 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ERVFC1P60507 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ERVFC1P60507 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ERVFC1P60507 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERVFC1P60507 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERVFC1P60507 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERVFC1P60507 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ERVFC1P60507 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ERVFC1P60507 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ERVFC1P60507 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERVFC1P60507 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERVFC1P60507 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERVFC1P60507 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ERVFC1P60507 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERVFC1P60507 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ERVFC1P60507 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ERVFC1P60507 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ERVFC1P60507 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ERVFC1P60507 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ERVFC1P60507 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ERVFC1P60507 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERVFC1P60507 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERVFC1P60507 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERVFC1P60507 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERVFC1P60507 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERVFC1P60507 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERVFC1P60507 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERVFC1P60507 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERVFC1P60507 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERVFC1P60507 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERVFC1P60507 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERVFC1P60507 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms