Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SNX16P57768 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SNX16P57768 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SNX16P57768 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SNX16P57768 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SNX16P57768 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SNX16P57768 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SNX16P57768 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SNX16P57768 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SNX16P57768 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SNX16P57768 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SNX16P57768 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SNX16P57768 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SNX16P57768 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SNX16P57768 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SNX16P57768 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SNX16P57768 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SNX16P57768 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SNX16P57768 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SNX16P57768 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SNX16P57768 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SNX16P57768 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SNX16P57768 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNX16P57768 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNX16P57768 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNX16P57768 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNX16P57768 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNX16P57768 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNX16P57768 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNX16P57768 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SNX16P57768 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SNX16P57768 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNX16P57768 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SNX16P57768 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNX16P57768 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNX16P57768 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNX16P57768 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SNX16P57768 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNX16P57768 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNX16P57768 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SNX16P57768 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SNX16P57768 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SNX16P57768 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SNX16P57768 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SNX16P57768 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SNX16P57768 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SNX16P57768 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SNX16P57768 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SNX16P57768 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNX16P57768 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SNX16P57768 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SNX16P57768 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNX16P57768 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNX16P57768 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNX16P57768 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNX16P57768 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SNX16P57768 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SNX16P57768 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SNX16P57768 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNX16P57768 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNX16P57768 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNX16P57768 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNX16P57768 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SNX16P57768 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNX16P57768 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNX16P57768 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNX16P57768 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNX16P57768 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNX16P57768 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNX16P57768 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNX16P57768 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SNX16P57768 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SNX16P57768 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SNX16P57768 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SNX16P57768 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SNX16P57768 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
SNX16P57768 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNX16P57768 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNX16P57768 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNX16P57768 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNX16P57768 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNX16P57768 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNX16P57768 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNX16P57768 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SNX16P57768 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SNX16P57768 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNX16P57768 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SNX16P57768 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNX16P57768 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNX16P57768 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNX16P57768 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNX16P57768 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNX16P57768 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SNX16P57768 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SNX16P57768 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SNX16P57768 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SNX16P57768 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SNX16P57768 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SNX16P57768 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SNX16P57768 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 300.2 ms