Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ELLP55199 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ELLP55199 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ELLP55199 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ELLP55199 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ELLP55199 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ELLP55199 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ELLP55199 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ELLP55199 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ELLP55199 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ELLP55199 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ELLP55199 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ELLP55199 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ELLP55199 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ELLP55199 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ELLP55199 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ELLP55199 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ELLP55199 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ELLP55199 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ELLP55199 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ELLP55199 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ELLP55199 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ELLP55199 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ELLP55199 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ELLP55199 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ELLP55199 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ELLP55199 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ELLP55199 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ELLP55199 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ELLP55199 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ELLP55199 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ELLP55199 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ELLP55199 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ELLP55199 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ELLP55199 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ELLP55199 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ELLP55199 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ELLP55199 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ELLP55199 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ELLP55199 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ELLP55199 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ELLP55199 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ELLP55199 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ELLP55199 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ELLP55199 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ELLP55199 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ELLP55199 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ELLP55199 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ELLP55199 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ELLP55199 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ELLP55199 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ELLP55199 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ELLP55199 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ELLP55199 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ELLP55199 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ELLP55199 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ELLP55199 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ELLP55199 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ELLP55199 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ELLP55199 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ELLP55199 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ELLP55199 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ELLP55199 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ELLP55199 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ELLP55199 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ELLP55199 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ELLP55199 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ELLP55199 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ELLP55199 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ELLP55199 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ELLP55199 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ELLP55199 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ELLP55199 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ELLP55199 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ELLP55199 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ELLP55199 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ELLP55199 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ELLP55199 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ELLP55199 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ELLP55199 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ELLP55199 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ELLP55199 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ELLP55199 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ELLP55199 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ELLP55199 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ELLP55199 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ELLP55199 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ELLP55199 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ELLP55199 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ELLP55199 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ELLP55199 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ELLP55199 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ELLP55199 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ELLP55199 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ELLP55199 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ELLP55199 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ELLP55199 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ELLP55199 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ELLP55199 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ELLP55199 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms