Protein–RNA interactions for Protein: P51610

HCFC1, Host cell factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCFC1P51610 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HCFC1P51610 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HCFC1P51610 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HCFC1P51610 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HCFC1P51610 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HCFC1P51610 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HCFC1P51610 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HCFC1P51610 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HCFC1P51610 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HCFC1P51610 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HCFC1P51610 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HCFC1P51610 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HCFC1P51610 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HCFC1P51610 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HCFC1P51610 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HCFC1P51610 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HCFC1P51610 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HCFC1P51610 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HCFC1P51610 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HCFC1P51610 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HCFC1P51610 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HCFC1P51610 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HCFC1P51610 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HCFC1P51610 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HCFC1P51610 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HCFC1P51610 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HCFC1P51610 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HCFC1P51610 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HCFC1P51610 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HCFC1P51610 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HCFC1P51610 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HCFC1P51610 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HCFC1P51610 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HCFC1P51610 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HCFC1P51610 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HCFC1P51610 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HCFC1P51610 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HCFC1P51610 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HCFC1P51610 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HCFC1P51610 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HCFC1P51610 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HCFC1P51610 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HCFC1P51610 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HCFC1P51610 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HCFC1P51610 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HCFC1P51610 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HCFC1P51610 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HCFC1P51610 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HCFC1P51610 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HCFC1P51610 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HCFC1P51610 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HCFC1P51610 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HCFC1P51610 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HCFC1P51610 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HCFC1P51610 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HCFC1P51610 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HCFC1P51610 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HCFC1P51610 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HCFC1P51610 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HCFC1P51610 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HCFC1P51610 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HCFC1P51610 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HCFC1P51610 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HCFC1P51610 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HCFC1P51610 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HCFC1P51610 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HCFC1P51610 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HCFC1P51610 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HCFC1P51610 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HCFC1P51610 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HCFC1P51610 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HCFC1P51610 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HCFC1P51610 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HCFC1P51610 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HCFC1P51610 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HCFC1P51610 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HCFC1P51610 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HCFC1P51610 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HCFC1P51610 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HCFC1P51610 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HCFC1P51610 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HCFC1P51610 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HCFC1P51610 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HCFC1P51610 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HCFC1P51610 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HCFC1P51610 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HCFC1P51610 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HCFC1P51610 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HCFC1P51610 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HCFC1P51610 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HCFC1P51610 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HCFC1P51610 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HCFC1P51610 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HCFC1P51610 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HCFC1P51610 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HCFC1P51610 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HCFC1P51610 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HCFC1P51610 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HCFC1P51610 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HCFC1P51610 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms