Protein–RNA interactions for Protein: P50395

GDI2, Rab GDP dissociation inhibitor beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDI2P50395 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDI2P50395 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GDI2P50395 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GDI2P50395 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GDI2P50395 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GDI2P50395 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GDI2P50395 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GDI2P50395 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDI2P50395 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GDI2P50395 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GDI2P50395 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GDI2P50395 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GDI2P50395 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GDI2P50395 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GDI2P50395 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GDI2P50395 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GDI2P50395 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GDI2P50395 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GDI2P50395 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GDI2P50395 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GDI2P50395 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GDI2P50395 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GDI2P50395 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GDI2P50395 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GDI2P50395 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GDI2P50395 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GDI2P50395 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GDI2P50395 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDI2P50395 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDI2P50395 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDI2P50395 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDI2P50395 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDI2P50395 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GDI2P50395 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GDI2P50395 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GDI2P50395 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GDI2P50395 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GDI2P50395 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDI2P50395 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDI2P50395 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDI2P50395 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDI2P50395 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GDI2P50395 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GDI2P50395 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GDI2P50395 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GDI2P50395 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDI2P50395 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDI2P50395 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDI2P50395 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDI2P50395 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GDI2P50395 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GDI2P50395 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDI2P50395 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDI2P50395 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GDI2P50395 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDI2P50395 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDI2P50395 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDI2P50395 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDI2P50395 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDI2P50395 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDI2P50395 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDI2P50395 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDI2P50395 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDI2P50395 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDI2P50395 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDI2P50395 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDI2P50395 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDI2P50395 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDI2P50395 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GDI2P50395 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDI2P50395 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDI2P50395 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDI2P50395 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDI2P50395 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDI2P50395 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GDI2P50395 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDI2P50395 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDI2P50395 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDI2P50395 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDI2P50395 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDI2P50395 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDI2P50395 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDI2P50395 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDI2P50395 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDI2P50395 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDI2P50395 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDI2P50395 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDI2P50395 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDI2P50395 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDI2P50395 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDI2P50395 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDI2P50395 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDI2P50395 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GDI2P50395 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GDI2P50395 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDI2P50395 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDI2P50395 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDI2P50395 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDI2P50395 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDI2P50395 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms