Protein–RNA interactions for Protein: P49757

NUMB, Protein numb homolog, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUMBP49757 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NUMBP49757 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NUMBP49757 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NUMBP49757 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUMBP49757 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUMBP49757 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUMBP49757 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NUMBP49757 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUMBP49757 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUMBP49757 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUMBP49757 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUMBP49757 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUMBP49757 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUMBP49757 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUMBP49757 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUMBP49757 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
NUMBP49757 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NUMBP49757 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NUMBP49757 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NUMBP49757 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NUMBP49757 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUMBP49757 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUMBP49757 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUMBP49757 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUMBP49757 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NUMBP49757 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUMBP49757 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUMBP49757 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUMBP49757 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUMBP49757 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUMBP49757 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUMBP49757 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUMBP49757 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUMBP49757 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUMBP49757 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUMBP49757 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NUMBP49757 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NUMBP49757 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NUMBP49757 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NUMBP49757 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NUMBP49757 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NUMBP49757 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NUMBP49757 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUMBP49757 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUMBP49757 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUMBP49757 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUMBP49757 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUMBP49757 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUMBP49757 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUMBP49757 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUMBP49757 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUMBP49757 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUMBP49757 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUMBP49757 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUMBP49757 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUMBP49757 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUMBP49757 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUMBP49757 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUMBP49757 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUMBP49757 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUMBP49757 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUMBP49757 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUMBP49757 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUMBP49757 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUMBP49757 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
NUMBP49757 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUMBP49757 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUMBP49757 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUMBP49757 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUMBP49757 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUMBP49757 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUMBP49757 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUMBP49757 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUMBP49757 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUMBP49757 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NUMBP49757 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUMBP49757 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUMBP49757 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUMBP49757 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUMBP49757 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUMBP49757 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUMBP49757 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUMBP49757 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NUMBP49757 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NUMBP49757 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NUMBP49757 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUMBP49757 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUMBP49757 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUMBP49757 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUMBP49757 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUMBP49757 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUMBP49757 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUMBP49757 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUMBP49757 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUMBP49757 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUMBP49757 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NUMBP49757 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUMBP49757 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NUMBP49757 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NUMBP49757 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.3 ms