Protein–RNA interactions for Protein: P49023

PXN, Paxillin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXNP49023 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PXNP49023 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PXNP49023 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PXNP49023 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PXNP49023 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PXNP49023 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PXNP49023 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PXNP49023 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PXNP49023 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PXNP49023 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PXNP49023 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PXNP49023 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PXNP49023 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PXNP49023 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PXNP49023 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PXNP49023 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PXNP49023 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PXNP49023 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PXNP49023 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PXNP49023 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PXNP49023 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PXNP49023 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PXNP49023 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PXNP49023 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PXNP49023 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PXNP49023 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PXNP49023 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PXNP49023 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PXNP49023 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PXNP49023 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PXNP49023 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PXNP49023 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PXNP49023 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PXNP49023 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PXNP49023 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PXNP49023 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PXNP49023 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PXNP49023 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PXNP49023 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PXNP49023 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PXNP49023 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PXNP49023 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PXNP49023 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PXNP49023 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PXNP49023 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PXNP49023 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PXNP49023 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PXNP49023 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PXNP49023 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PXNP49023 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PXNP49023 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PXNP49023 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PXNP49023 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PXNP49023 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PXNP49023 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PXNP49023 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PXNP49023 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PXNP49023 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PXNP49023 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PXNP49023 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PXNP49023 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PXNP49023 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PXNP49023 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PXNP49023 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PXNP49023 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PXNP49023 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PXNP49023 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PXNP49023 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PXNP49023 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PXNP49023 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PXNP49023 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PXNP49023 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PXNP49023 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PXNP49023 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PXNP49023 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PXNP49023 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PXNP49023 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PXNP49023 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PXNP49023 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PXNP49023 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PXNP49023 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PXNP49023 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PXNP49023 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PXNP49023 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PXNP49023 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PXNP49023 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PXNP49023 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PXNP49023 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PXNP49023 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PXNP49023 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PXNP49023 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PXNP49023 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PXNP49023 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PXNP49023 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PXNP49023 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PXNP49023 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PXNP49023 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PXNP49023 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PXNP49023 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PXNP49023 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms