Protein–RNA interactions for Protein: P48764

SLC9A3, Sodium/hydrogen exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3P48764 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC9A3P48764 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC9A3P48764 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC9A3P48764 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC9A3P48764 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC9A3P48764 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC9A3P48764 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC9A3P48764 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC9A3P48764 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC9A3P48764 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC9A3P48764 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC9A3P48764 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC9A3P48764 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC9A3P48764 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC9A3P48764 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC9A3P48764 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC9A3P48764 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC9A3P48764 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC9A3P48764 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC9A3P48764 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC9A3P48764 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC9A3P48764 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC9A3P48764 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC9A3P48764 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC9A3P48764 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC9A3P48764 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC9A3P48764 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC9A3P48764 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC9A3P48764 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC9A3P48764 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC9A3P48764 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC9A3P48764 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC9A3P48764 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC9A3P48764 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC9A3P48764 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC9A3P48764 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC9A3P48764 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC9A3P48764 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC9A3P48764 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC9A3P48764 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC9A3P48764 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC9A3P48764 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC9A3P48764 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC9A3P48764 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC9A3P48764 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC9A3P48764 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC9A3P48764 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC9A3P48764 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC9A3P48764 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC9A3P48764 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC9A3P48764 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC9A3P48764 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC9A3P48764 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC9A3P48764 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC9A3P48764 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC9A3P48764 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC9A3P48764 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC9A3P48764 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC9A3P48764 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC9A3P48764 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC9A3P48764 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC9A3P48764 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC9A3P48764 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC9A3P48764 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC9A3P48764 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC9A3P48764 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC9A3P48764 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC9A3P48764 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC9A3P48764 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC9A3P48764 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC9A3P48764 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC9A3P48764 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC9A3P48764 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC9A3P48764 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC9A3P48764 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC9A3P48764 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC9A3P48764 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC9A3P48764 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC9A3P48764 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC9A3P48764 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC9A3P48764 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC9A3P48764 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC9A3P48764 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC9A3P48764 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC9A3P48764 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC9A3P48764 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC9A3P48764 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC9A3P48764 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC9A3P48764 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC9A3P48764 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC9A3P48764 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC9A3P48764 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC9A3P48764 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC9A3P48764 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC9A3P48764 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC9A3P48764 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC9A3P48764 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC9A3P48764 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC9A3P48764 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC9A3P48764 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms