Protein–RNA interactions for Protein: P48029

SLC6A8, Sodium- and chloride-dependent creatine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A8P48029 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC6A8P48029 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC6A8P48029 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC6A8P48029 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC6A8P48029 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC6A8P48029 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC6A8P48029 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC6A8P48029 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC6A8P48029 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC6A8P48029 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC6A8P48029 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC6A8P48029 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC6A8P48029 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC6A8P48029 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC6A8P48029 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC6A8P48029 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC6A8P48029 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC6A8P48029 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC6A8P48029 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC6A8P48029 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC6A8P48029 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC6A8P48029 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC6A8P48029 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC6A8P48029 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC6A8P48029 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC6A8P48029 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC6A8P48029 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC6A8P48029 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC6A8P48029 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC6A8P48029 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC6A8P48029 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC6A8P48029 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC6A8P48029 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC6A8P48029 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC6A8P48029 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC6A8P48029 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC6A8P48029 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC6A8P48029 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC6A8P48029 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC6A8P48029 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC6A8P48029 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC6A8P48029 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC6A8P48029 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC6A8P48029 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC6A8P48029 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC6A8P48029 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC6A8P48029 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC6A8P48029 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC6A8P48029 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC6A8P48029 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC6A8P48029 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC6A8P48029 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC6A8P48029 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC6A8P48029 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC6A8P48029 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC6A8P48029 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC6A8P48029 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC6A8P48029 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC6A8P48029 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC6A8P48029 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC6A8P48029 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC6A8P48029 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC6A8P48029 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC6A8P48029 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC6A8P48029 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC6A8P48029 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC6A8P48029 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC6A8P48029 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC6A8P48029 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC6A8P48029 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC6A8P48029 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC6A8P48029 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC6A8P48029 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC6A8P48029 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC6A8P48029 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC6A8P48029 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC6A8P48029 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC6A8P48029 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC6A8P48029 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC6A8P48029 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC6A8P48029 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC6A8P48029 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC6A8P48029 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC6A8P48029 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC6A8P48029 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC6A8P48029 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC6A8P48029 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC6A8P48029 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC6A8P48029 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC6A8P48029 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC6A8P48029 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC6A8P48029 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC6A8P48029 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC6A8P48029 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC6A8P48029 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC6A8P48029 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC6A8P48029 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC6A8P48029 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC6A8P48029 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC6A8P48029 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms