Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDKN1BP46527 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDKN1BP46527 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDKN1BP46527 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CDKN1BP46527 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDKN1BP46527 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDKN1BP46527 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDKN1BP46527 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDKN1BP46527 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDKN1BP46527 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDKN1BP46527 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDKN1BP46527 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDKN1BP46527 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDKN1BP46527 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDKN1BP46527 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDKN1BP46527 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDKN1BP46527 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDKN1BP46527 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDKN1BP46527 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDKN1BP46527 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDKN1BP46527 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CDKN1BP46527 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDKN1BP46527 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDKN1BP46527 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDKN1BP46527 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDKN1BP46527 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDKN1BP46527 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDKN1BP46527 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDKN1BP46527 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDKN1BP46527 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CDKN1BP46527 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDKN1BP46527 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDKN1BP46527 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDKN1BP46527 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDKN1BP46527 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CDKN1BP46527 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDKN1BP46527 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDKN1BP46527 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CDKN1BP46527 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CDKN1BP46527 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDKN1BP46527 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDKN1BP46527 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CDKN1BP46527 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDKN1BP46527 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDKN1BP46527 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDKN1BP46527 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDKN1BP46527 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDKN1BP46527 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDKN1BP46527 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDKN1BP46527 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDKN1BP46527 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDKN1BP46527 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDKN1BP46527 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDKN1BP46527 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDKN1BP46527 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDKN1BP46527 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDKN1BP46527 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDKN1BP46527 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDKN1BP46527 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDKN1BP46527 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDKN1BP46527 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDKN1BP46527 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDKN1BP46527 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CDKN1BP46527 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDKN1BP46527 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDKN1BP46527 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDKN1BP46527 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDKN1BP46527 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDKN1BP46527 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDKN1BP46527 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CDKN1BP46527 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CDKN1BP46527 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CDKN1BP46527 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDKN1BP46527 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDKN1BP46527 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDKN1BP46527 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDKN1BP46527 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDKN1BP46527 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDKN1BP46527 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDKN1BP46527 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDKN1BP46527 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDKN1BP46527 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CDKN1BP46527 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CDKN1BP46527 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDKN1BP46527 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDKN1BP46527 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDKN1BP46527 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDKN1BP46527 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDKN1BP46527 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CDKN1BP46527 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDKN1BP46527 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDKN1BP46527 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDKN1BP46527 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDKN1BP46527 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDKN1BP46527 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDKN1BP46527 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDKN1BP46527 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDKN1BP46527 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDKN1BP46527 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDKN1BP46527 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms