Protein–RNA interactions for Protein: P42574

CASP3, Caspase-3, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP3P42574 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASP3P42574 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASP3P42574 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASP3P42574 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASP3P42574 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CASP3P42574 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASP3P42574 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASP3P42574 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASP3P42574 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CASP3P42574 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASP3P42574 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASP3P42574 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASP3P42574 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASP3P42574 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASP3P42574 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASP3P42574 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CASP3P42574 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CASP3P42574 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASP3P42574 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASP3P42574 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASP3P42574 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CASP3P42574 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASP3P42574 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP3P42574 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP3P42574 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP3P42574 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASP3P42574 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASP3P42574 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASP3P42574 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASP3P42574 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP3P42574 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP3P42574 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP3P42574 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP3P42574 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP3P42574 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP3P42574 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP3P42574 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP3P42574 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP3P42574 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP3P42574 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP3P42574 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP3P42574 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP3P42574 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP3P42574 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP3P42574 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP3P42574 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP3P42574 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASP3P42574 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASP3P42574 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASP3P42574 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASP3P42574 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CASP3P42574 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASP3P42574 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASP3P42574 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CASP3P42574 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASP3P42574 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASP3P42574 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASP3P42574 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASP3P42574 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASP3P42574 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASP3P42574 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASP3P42574 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CASP3P42574 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CASP3P42574 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASP3P42574 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP3P42574 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP3P42574 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP3P42574 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP3P42574 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASP3P42574 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASP3P42574 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASP3P42574 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASP3P42574 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASP3P42574 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP3P42574 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP3P42574 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP3P42574 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASP3P42574 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASP3P42574 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASP3P42574 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASP3P42574 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASP3P42574 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASP3P42574 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASP3P42574 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASP3P42574 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASP3P42574 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASP3P42574 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP3P42574 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP3P42574 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP3P42574 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASP3P42574 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASP3P42574 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CASP3P42574 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASP3P42574 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASP3P42574 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASP3P42574 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASP3P42574 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CASP3P42574 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CASP3P42574 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CASP3P42574 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms