Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PIK3CBP42338 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PIK3CBP42338 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PIK3CBP42338 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PIK3CBP42338 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PIK3CBP42338 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PIK3CBP42338 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PIK3CBP42338 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PIK3CBP42338 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PIK3CBP42338 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PIK3CBP42338 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PIK3CBP42338 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PIK3CBP42338 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PIK3CBP42338 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PIK3CBP42338 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PIK3CBP42338 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIK3CBP42338 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIK3CBP42338 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIK3CBP42338 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIK3CBP42338 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIK3CBP42338 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIK3CBP42338 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PIK3CBP42338 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIK3CBP42338 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PIK3CBP42338 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIK3CBP42338 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIK3CBP42338 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIK3CBP42338 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIK3CBP42338 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIK3CBP42338 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PIK3CBP42338 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PIK3CBP42338 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIK3CBP42338 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIK3CBP42338 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIK3CBP42338 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIK3CBP42338 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3CBP42338 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3CBP42338 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3CBP42338 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3CBP42338 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIK3CBP42338 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIK3CBP42338 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIK3CBP42338 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIK3CBP42338 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIK3CBP42338 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIK3CBP42338 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIK3CBP42338 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PIK3CBP42338 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PIK3CBP42338 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PIK3CBP42338 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIK3CBP42338 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIK3CBP42338 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIK3CBP42338 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIK3CBP42338 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIK3CBP42338 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIK3CBP42338 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIK3CBP42338 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIK3CBP42338 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PIK3CBP42338 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PIK3CBP42338 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PIK3CBP42338 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PIK3CBP42338 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PIK3CBP42338 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIK3CBP42338 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIK3CBP42338 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIK3CBP42338 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PIK3CBP42338 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIK3CBP42338 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIK3CBP42338 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PIK3CBP42338 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIK3CBP42338 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIK3CBP42338 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIK3CBP42338 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIK3CBP42338 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PIK3CBP42338 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIK3CBP42338 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PIK3CBP42338 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PIK3CBP42338 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIK3CBP42338 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIK3CBP42338 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PIK3CBP42338 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIK3CBP42338 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIK3CBP42338 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIK3CBP42338 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PIK3CBP42338 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIK3CBP42338 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PIK3CBP42338 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PIK3CBP42338 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIK3CBP42338 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3CBP42338 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIK3CBP42338 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PIK3CBP42338 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIK3CBP42338 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIK3CBP42338 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIK3CBP42338 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PIK3CBP42338 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIK3CBP42338 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIK3CBP42338 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIK3CBP42338 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3CBP42338 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms