Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBEC1P41238 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC1P41238 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBEC1P41238 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBEC1P41238 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBEC1P41238 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBEC1P41238 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBEC1P41238 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOBEC1P41238 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOBEC1P41238 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOBEC1P41238 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOBEC1P41238 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOBEC1P41238 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOBEC1P41238 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOBEC1P41238 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOBEC1P41238 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOBEC1P41238 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOBEC1P41238 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOBEC1P41238 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOBEC1P41238 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOBEC1P41238 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOBEC1P41238 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
APOBEC1P41238 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBEC1P41238 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBEC1P41238 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBEC1P41238 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBEC1P41238 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBEC1P41238 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBEC1P41238 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBEC1P41238 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
APOBEC1P41238 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOBEC1P41238 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOBEC1P41238 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOBEC1P41238 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APOBEC1P41238 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24■■□□□ 1.43
APOBEC1P41238 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
APOBEC1P41238 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
APOBEC1P41238 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
APOBEC1P41238 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
APOBEC1P41238 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOBEC1P41238 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOBEC1P41238 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOBEC1P41238 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOBEC1P41238 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOBEC1P41238 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOBEC1P41238 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOBEC1P41238 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOBEC1P41238 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOBEC1P41238 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOBEC1P41238 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBEC1P41238 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBEC1P41238 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBEC1P41238 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBEC1P41238 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBEC1P41238 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBEC1P41238 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBEC1P41238 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOBEC1P41238 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOBEC1P41238 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOBEC1P41238 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
APOBEC1P41238 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBEC1P41238 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBEC1P41238 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBEC1P41238 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBEC1P41238 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOBEC1P41238 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
APOBEC1P41238 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOBEC1P41238 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOBEC1P41238 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
APOBEC1P41238 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
APOBEC1P41238 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOBEC1P41238 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOBEC1P41238 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOBEC1P41238 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOBEC1P41238 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
APOBEC1P41238 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBEC1P41238 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBEC1P41238 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBEC1P41238 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBEC1P41238 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBEC1P41238 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBEC1P41238 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBEC1P41238 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBEC1P41238 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBEC1P41238 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBEC1P41238 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBEC1P41238 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOBEC1P41238 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
APOBEC1P41238 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOBEC1P41238 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOBEC1P41238 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBEC1P41238 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBEC1P41238 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBEC1P41238 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOBEC1P41238 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOBEC1P41238 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOBEC1P41238 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOBEC1P41238 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOBEC1P41238 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOBEC1P41238 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms