Protein–RNA interactions for Protein: P40967

PMEL, Melanocyte protein PMEL, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMELP40967 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PMELP40967 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PMELP40967 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PMELP40967 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PMELP40967 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMELP40967 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMELP40967 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMELP40967 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMELP40967 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMELP40967 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMELP40967 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMELP40967 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMELP40967 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMELP40967 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMELP40967 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PMELP40967 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PMELP40967 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMELP40967 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMELP40967 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMELP40967 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PMELP40967 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PMELP40967 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PMELP40967 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PMELP40967 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMELP40967 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMELP40967 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMELP40967 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMELP40967 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PMELP40967 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PMELP40967 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PMELP40967 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PMELP40967 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PMELP40967 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PMELP40967 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PMELP40967 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PMELP40967 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PMELP40967 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PMELP40967 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PMELP40967 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PMELP40967 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PMELP40967 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMELP40967 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMELP40967 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMELP40967 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMELP40967 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMELP40967 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMELP40967 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PMELP40967 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PMELP40967 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PMELP40967 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PMELP40967 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PMELP40967 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PMELP40967 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PMELP40967 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PMELP40967 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PMELP40967 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PMELP40967 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PMELP40967 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PMELP40967 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PMELP40967 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PMELP40967 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PMELP40967 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PMELP40967 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PMELP40967 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PMELP40967 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PMELP40967 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PMELP40967 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PMELP40967 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PMELP40967 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PMELP40967 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PMELP40967 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PMELP40967 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PMELP40967 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PMELP40967 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PMELP40967 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PMELP40967 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PMELP40967 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PMELP40967 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PMELP40967 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PMELP40967 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PMELP40967 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PMELP40967 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PMELP40967 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PMELP40967 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PMELP40967 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PMELP40967 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PMELP40967 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PMELP40967 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PMELP40967 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PMELP40967 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PMELP40967 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PMELP40967 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PMELP40967 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PMELP40967 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PMELP40967 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PMELP40967 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PMELP40967 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PMELP40967 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PMELP40967 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PMELP40967 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms