Protein–RNA interactions for Protein: P40939

HADHA, Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHAP40939 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HADHAP40939 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HADHAP40939 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HADHAP40939 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HADHAP40939 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HADHAP40939 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
HADHAP40939 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
HADHAP40939 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HADHAP40939 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HADHAP40939 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HADHAP40939 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HADHAP40939 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HADHAP40939 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HADHAP40939 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HADHAP40939 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HADHAP40939 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HADHAP40939 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HADHAP40939 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HADHAP40939 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
HADHAP40939 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HADHAP40939 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
HADHAP40939 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HADHAP40939 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HADHAP40939 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HADHAP40939 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HADHAP40939 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HADHAP40939 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HADHAP40939 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HADHAP40939 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HADHAP40939 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HADHAP40939 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HADHAP40939 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HADHAP40939 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HADHAP40939 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HADHAP40939 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HADHAP40939 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HADHAP40939 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HADHAP40939 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HADHAP40939 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HADHAP40939 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HADHAP40939 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HADHAP40939 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HADHAP40939 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
HADHAP40939 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HADHAP40939 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HADHAP40939 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HADHAP40939 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
HADHAP40939 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HADHAP40939 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HADHAP40939 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HADHAP40939 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HADHAP40939 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HADHAP40939 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HADHAP40939 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HADHAP40939 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HADHAP40939 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HADHAP40939 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HADHAP40939 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HADHAP40939 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HADHAP40939 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HADHAP40939 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HADHAP40939 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HADHAP40939 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HADHAP40939 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HADHAP40939 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HADHAP40939 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HADHAP40939 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HADHAP40939 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HADHAP40939 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HADHAP40939 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HADHAP40939 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HADHAP40939 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HADHAP40939 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HADHAP40939 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
HADHAP40939 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HADHAP40939 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HADHAP40939 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HADHAP40939 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HADHAP40939 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HADHAP40939 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HADHAP40939 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HADHAP40939 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HADHAP40939 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HADHAP40939 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HADHAP40939 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HADHAP40939 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HADHAP40939 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HADHAP40939 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HADHAP40939 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
HADHAP40939 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HADHAP40939 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HADHAP40939 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HADHAP40939 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HADHAP40939 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HADHAP40939 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HADHAP40939 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HADHAP40939 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HADHAP40939 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HADHAP40939 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HADHAP40939 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms