Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ACTN2P35609 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ACTN2P35609 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ACTN2P35609 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ACTN2P35609 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ACTN2P35609 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ACTN2P35609 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ACTN2P35609 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ACTN2P35609 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ACTN2P35609 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ACTN2P35609 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ACTN2P35609 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ACTN2P35609 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ACTN2P35609 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ACTN2P35609 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ACTN2P35609 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ACTN2P35609 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ACTN2P35609 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ACTN2P35609 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ACTN2P35609 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ACTN2P35609 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ACTN2P35609 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ACTN2P35609 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ACTN2P35609 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ACTN2P35609 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ACTN2P35609 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ACTN2P35609 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ACTN2P35609 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ACTN2P35609 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ACTN2P35609 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ACTN2P35609 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ACTN2P35609 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ACTN2P35609 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ACTN2P35609 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ACTN2P35609 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ACTN2P35609 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ACTN2P35609 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ACTN2P35609 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ACTN2P35609 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ACTN2P35609 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ACTN2P35609 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ACTN2P35609 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ACTN2P35609 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ACTN2P35609 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ACTN2P35609 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ACTN2P35609 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ACTN2P35609 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ACTN2P35609 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ACTN2P35609 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ACTN2P35609 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ACTN2P35609 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ACTN2P35609 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ACTN2P35609 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ACTN2P35609 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
ACTN2P35609 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ACTN2P35609 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ACTN2P35609 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ACTN2P35609 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ACTN2P35609 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ACTN2P35609 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ACTN2P35609 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ACTN2P35609 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ACTN2P35609 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ACTN2P35609 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ACTN2P35609 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ACTN2P35609 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ACTN2P35609 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ACTN2P35609 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ACTN2P35609 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ACTN2P35609 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ACTN2P35609 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ACTN2P35609 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ACTN2P35609 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ACTN2P35609 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ACTN2P35609 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ACTN2P35609 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ACTN2P35609 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ACTN2P35609 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ACTN2P35609 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ACTN2P35609 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ACTN2P35609 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ACTN2P35609 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ACTN2P35609 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ACTN2P35609 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ACTN2P35609 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ACTN2P35609 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ACTN2P35609 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ACTN2P35609 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ACTN2P35609 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ACTN2P35609 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ACTN2P35609 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ACTN2P35609 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ACTN2P35609 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ACTN2P35609 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ACTN2P35609 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ACTN2P35609 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ACTN2P35609 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ACTN2P35609 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ACTN2P35609 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ACTN2P35609 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms