Protein–RNA interactions for Protein: P35558

PCK1, Phosphoenolpyruvate carboxykinase, cytosolic [GTP], humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK1P35558 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCK1P35558 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCK1P35558 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCK1P35558 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCK1P35558 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PCK1P35558 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCK1P35558 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCK1P35558 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCK1P35558 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCK1P35558 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PCK1P35558 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PCK1P35558 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCK1P35558 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PCK1P35558 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCK1P35558 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCK1P35558 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCK1P35558 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PCK1P35558 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCK1P35558 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCK1P35558 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCK1P35558 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCK1P35558 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCK1P35558 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCK1P35558 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCK1P35558 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCK1P35558 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCK1P35558 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCK1P35558 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCK1P35558 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCK1P35558 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCK1P35558 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCK1P35558 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCK1P35558 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCK1P35558 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCK1P35558 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCK1P35558 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCK1P35558 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCK1P35558 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCK1P35558 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCK1P35558 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCK1P35558 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCK1P35558 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCK1P35558 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PCK1P35558 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCK1P35558 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCK1P35558 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCK1P35558 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCK1P35558 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCK1P35558 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCK1P35558 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCK1P35558 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCK1P35558 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCK1P35558 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCK1P35558 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCK1P35558 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCK1P35558 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCK1P35558 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCK1P35558 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCK1P35558 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCK1P35558 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCK1P35558 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCK1P35558 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCK1P35558 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCK1P35558 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCK1P35558 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCK1P35558 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCK1P35558 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCK1P35558 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCK1P35558 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCK1P35558 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCK1P35558 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCK1P35558 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCK1P35558 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCK1P35558 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCK1P35558 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCK1P35558 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCK1P35558 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCK1P35558 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCK1P35558 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCK1P35558 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCK1P35558 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCK1P35558 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PCK1P35558 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PCK1P35558 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PCK1P35558 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PCK1P35558 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PCK1P35558 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
PCK1P35558 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PCK1P35558 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PCK1P35558 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PCK1P35558 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PCK1P35558 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PCK1P35558 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PCK1P35558 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PCK1P35558 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PCK1P35558 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PCK1P35558 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PCK1P35558 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PCK1P35558 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PCK1P35558 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.51■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms