Protein–RNA interactions for Protein: P32004

L1CAM, Neural cell adhesion molecule L1, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1CAMP32004 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
L1CAMP32004 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
L1CAMP32004 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
L1CAMP32004 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
L1CAMP32004 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
L1CAMP32004 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
L1CAMP32004 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
L1CAMP32004 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
L1CAMP32004 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
L1CAMP32004 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
L1CAMP32004 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
L1CAMP32004 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
L1CAMP32004 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
L1CAMP32004 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
L1CAMP32004 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
L1CAMP32004 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
L1CAMP32004 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
L1CAMP32004 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
L1CAMP32004 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
L1CAMP32004 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
L1CAMP32004 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
L1CAMP32004 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
L1CAMP32004 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
L1CAMP32004 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
L1CAMP32004 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
L1CAMP32004 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
L1CAMP32004 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
L1CAMP32004 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
L1CAMP32004 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
L1CAMP32004 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
L1CAMP32004 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
L1CAMP32004 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
L1CAMP32004 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
L1CAMP32004 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
L1CAMP32004 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
L1CAMP32004 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
L1CAMP32004 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
L1CAMP32004 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
L1CAMP32004 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
L1CAMP32004 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
L1CAMP32004 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
L1CAMP32004 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
L1CAMP32004 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
L1CAMP32004 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
L1CAMP32004 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
L1CAMP32004 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
L1CAMP32004 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
L1CAMP32004 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
L1CAMP32004 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
L1CAMP32004 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
L1CAMP32004 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
L1CAMP32004 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
L1CAMP32004 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
L1CAMP32004 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.53■■■□□ 2
L1CAMP32004 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
L1CAMP32004 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
L1CAMP32004 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
L1CAMP32004 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
L1CAMP32004 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
L1CAMP32004 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
L1CAMP32004 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
L1CAMP32004 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
L1CAMP32004 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
L1CAMP32004 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
L1CAMP32004 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
L1CAMP32004 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
L1CAMP32004 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
L1CAMP32004 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
L1CAMP32004 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
L1CAMP32004 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
L1CAMP32004 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
L1CAMP32004 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
L1CAMP32004 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
L1CAMP32004 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
L1CAMP32004 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
L1CAMP32004 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
L1CAMP32004 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
L1CAMP32004 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
L1CAMP32004 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
L1CAMP32004 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
L1CAMP32004 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
L1CAMP32004 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
L1CAMP32004 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
L1CAMP32004 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
L1CAMP32004 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
L1CAMP32004 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
L1CAMP32004 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
L1CAMP32004 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
L1CAMP32004 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
L1CAMP32004 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
L1CAMP32004 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
L1CAMP32004 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
L1CAMP32004 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
L1CAMP32004 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
L1CAMP32004 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
L1CAMP32004 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
L1CAMP32004 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
L1CAMP32004 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
L1CAMP32004 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
L1CAMP32004 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms