Protein–RNA interactions for Protein: P31930

UQCRC1, Cytochrome b-c1 complex subunit 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UQCRC1P31930 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UQCRC1P31930 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UQCRC1P31930 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UQCRC1P31930 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UQCRC1P31930 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UQCRC1P31930 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UQCRC1P31930 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UQCRC1P31930 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UQCRC1P31930 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UQCRC1P31930 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UQCRC1P31930 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UQCRC1P31930 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UQCRC1P31930 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UQCRC1P31930 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UQCRC1P31930 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UQCRC1P31930 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UQCRC1P31930 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UQCRC1P31930 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
UQCRC1P31930 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UQCRC1P31930 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UQCRC1P31930 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UQCRC1P31930 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UQCRC1P31930 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UQCRC1P31930 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UQCRC1P31930 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UQCRC1P31930 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UQCRC1P31930 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UQCRC1P31930 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UQCRC1P31930 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UQCRC1P31930 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UQCRC1P31930 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UQCRC1P31930 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UQCRC1P31930 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UQCRC1P31930 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UQCRC1P31930 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UQCRC1P31930 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UQCRC1P31930 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
UQCRC1P31930 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UQCRC1P31930 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UQCRC1P31930 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UQCRC1P31930 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UQCRC1P31930 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UQCRC1P31930 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UQCRC1P31930 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UQCRC1P31930 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UQCRC1P31930 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UQCRC1P31930 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UQCRC1P31930 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UQCRC1P31930 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UQCRC1P31930 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
UQCRC1P31930 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UQCRC1P31930 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UQCRC1P31930 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UQCRC1P31930 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UQCRC1P31930 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UQCRC1P31930 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UQCRC1P31930 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UQCRC1P31930 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
UQCRC1P31930 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UQCRC1P31930 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UQCRC1P31930 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UQCRC1P31930 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
UQCRC1P31930 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UQCRC1P31930 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
UQCRC1P31930 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UQCRC1P31930 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UQCRC1P31930 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UQCRC1P31930 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UQCRC1P31930 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UQCRC1P31930 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UQCRC1P31930 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
UQCRC1P31930 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UQCRC1P31930 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UQCRC1P31930 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UQCRC1P31930 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
UQCRC1P31930 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UQCRC1P31930 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UQCRC1P31930 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UQCRC1P31930 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UQCRC1P31930 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UQCRC1P31930 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UQCRC1P31930 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
UQCRC1P31930 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UQCRC1P31930 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UQCRC1P31930 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UQCRC1P31930 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UQCRC1P31930 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
UQCRC1P31930 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UQCRC1P31930 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UQCRC1P31930 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UQCRC1P31930 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UQCRC1P31930 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UQCRC1P31930 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UQCRC1P31930 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UQCRC1P31930 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UQCRC1P31930 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UQCRC1P31930 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UQCRC1P31930 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UQCRC1P31930 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UQCRC1P31930 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms