Protein–RNA interactions for Protein: P31323

PRKAR2B, cAMP-dependent protein kinase type II-beta regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAR2BP31323 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
PRKAR2BP31323 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
PRKAR2BP31323 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
PRKAR2BP31323 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
PRKAR2BP31323 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PRKAR2BP31323 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PRKAR2BP31323 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PRKAR2BP31323 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC35.42■■■■□ 3.26
PRKAR2BP31323 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
PRKAR2BP31323 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
PRKAR2BP31323 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC35.4■■■■□ 3.26
PRKAR2BP31323 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
PRKAR2BP31323 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
PRKAR2BP31323 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
PRKAR2BP31323 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
PRKAR2BP31323 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
PRKAR2BP31323 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
PRKAR2BP31323 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
PRKAR2BP31323 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PRKAR2BP31323 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
PRKAR2BP31323 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PRKAR2BP31323 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PRKAR2BP31323 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PRKAR2BP31323 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PRKAR2BP31323 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PRKAR2BP31323 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PRKAR2BP31323 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
PRKAR2BP31323 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
PRKAR2BP31323 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
PRKAR2BP31323 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
PRKAR2BP31323 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PRKAR2BP31323 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
PRKAR2BP31323 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PRKAR2BP31323 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PRKAR2BP31323 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PRKAR2BP31323 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
PRKAR2BP31323 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
PRKAR2BP31323 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PRKAR2BP31323 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PRKAR2BP31323 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PRKAR2BP31323 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC35.27■■■■□ 3.24
PRKAR2BP31323 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
PRKAR2BP31323 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
PRKAR2BP31323 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
PRKAR2BP31323 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
PRKAR2BP31323 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
PRKAR2BP31323 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC35.25■■■■□ 3.23
PRKAR2BP31323 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC35.24■■■■□ 3.23
PRKAR2BP31323 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
PRKAR2BP31323 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
PRKAR2BP31323 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
PRKAR2BP31323 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PRKAR2BP31323 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PRKAR2BP31323 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PRKAR2BP31323 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PRKAR2BP31323 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
PRKAR2BP31323 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
PRKAR2BP31323 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PRKAR2BP31323 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PRKAR2BP31323 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PRKAR2BP31323 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PRKAR2BP31323 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PRKAR2BP31323 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PRKAR2BP31323 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PRKAR2BP31323 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PRKAR2BP31323 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PRKAR2BP31323 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
PRKAR2BP31323 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
PRKAR2BP31323 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
PRKAR2BP31323 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PRKAR2BP31323 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
PRKAR2BP31323 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PRKAR2BP31323 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PRKAR2BP31323 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
PRKAR2BP31323 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
PRKAR2BP31323 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
PRKAR2BP31323 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC35.13■■■■□ 3.21
PRKAR2BP31323 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PRKAR2BP31323 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PRKAR2BP31323 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
PRKAR2BP31323 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PRKAR2BP31323 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PRKAR2BP31323 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PRKAR2BP31323 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
PRKAR2BP31323 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
PRKAR2BP31323 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
PRKAR2BP31323 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
PRKAR2BP31323 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
PRKAR2BP31323 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PRKAR2BP31323 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PRKAR2BP31323 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.2
PRKAR2BP31323 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.2
PRKAR2BP31323 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
PRKAR2BP31323 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PRKAR2BP31323 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PRKAR2BP31323 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
PRKAR2BP31323 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
PRKAR2BP31323 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
PRKAR2BP31323 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
PRKAR2BP31323 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms