Protein–RNA interactions for Protein: P30531

SLC6A1, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A1P30531 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC6A1P30531 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A1P30531 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A1P30531 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A1P30531 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A1P30531 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A1P30531 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A1P30531 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A1P30531 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A1P30531 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A1P30531 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A1P30531 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A1P30531 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A1P30531 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A1P30531 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A1P30531 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A1P30531 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A1P30531 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A1P30531 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A1P30531 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A1P30531 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A1P30531 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A1P30531 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A1P30531 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A1P30531 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A1P30531 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A1P30531 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A1P30531 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A1P30531 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A1P30531 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC6A1P30531 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC6A1P30531 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC6A1P30531 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC6A1P30531 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC6A1P30531 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC6A1P30531 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC6A1P30531 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC6A1P30531 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC6A1P30531 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC6A1P30531 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC6A1P30531 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC6A1P30531 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC6A1P30531 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC6A1P30531 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A1P30531 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A1P30531 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC6A1P30531 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC6A1P30531 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC6A1P30531 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A1P30531 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A1P30531 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A1P30531 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A1P30531 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A1P30531 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A1P30531 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A1P30531 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A1P30531 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A1P30531 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A1P30531 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A1P30531 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A1P30531 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A1P30531 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A1P30531 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A1P30531 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A1P30531 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A1P30531 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A1P30531 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A1P30531 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A1P30531 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A1P30531 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A1P30531 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A1P30531 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A1P30531 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A1P30531 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A1P30531 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A1P30531 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A1P30531 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A1P30531 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A1P30531 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A1P30531 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A1P30531 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A1P30531 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A1P30531 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A1P30531 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A1P30531 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A1P30531 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC6A1P30531 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC6A1P30531 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A1P30531 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A1P30531 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A1P30531 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A1P30531 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A1P30531 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A1P30531 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A1P30531 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A1P30531 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A1P30531 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A1P30531 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A1P30531 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A1P30531 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms