Protein–RNA interactions for Protein: P29475

NOS1, Nitric oxide synthase, brain, humanhuman

Predictions only

Length 1,434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOS1P29475 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
NOS1P29475 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
NOS1P29475 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC39.42■■■■□ 3.9
NOS1P29475 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC39.42■■■■□ 3.9
NOS1P29475 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
NOS1P29475 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
NOS1P29475 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
NOS1P29475 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.42■■■■□ 3.9
NOS1P29475 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC39.41■■■■□ 3.9
NOS1P29475 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
NOS1P29475 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
NOS1P29475 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
NOS1P29475 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
NOS1P29475 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC39.39■■■■□ 3.9
NOS1P29475 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
NOS1P29475 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC39.37■■■■□ 3.89
NOS1P29475 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC39.37■■■■□ 3.89
NOS1P29475 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC39.37■■■■□ 3.89
NOS1P29475 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
NOS1P29475 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
NOS1P29475 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC39.35■■■■□ 3.89
NOS1P29475 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC39.34■■■■□ 3.89
NOS1P29475 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
NOS1P29475 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC39.31■■■■□ 3.88
NOS1P29475 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC39.31■■■■□ 3.88
NOS1P29475 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
NOS1P29475 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
NOS1P29475 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
NOS1P29475 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
NOS1P29475 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
NOS1P29475 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
NOS1P29475 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
NOS1P29475 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
NOS1P29475 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
NOS1P29475 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
NOS1P29475 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
NOS1P29475 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
NOS1P29475 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
NOS1P29475 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
NOS1P29475 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
NOS1P29475 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
NOS1P29475 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
NOS1P29475 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC39.18■■■■□ 3.86
NOS1P29475 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
NOS1P29475 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
NOS1P29475 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
NOS1P29475 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC39.16■■■■□ 3.86
NOS1P29475 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
NOS1P29475 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
NOS1P29475 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
NOS1P29475 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
NOS1P29475 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
NOS1P29475 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
NOS1P29475 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.85
NOS1P29475 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
NOS1P29475 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.85
NOS1P29475 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC39.12■■■■□ 3.85
NOS1P29475 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
NOS1P29475 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
NOS1P29475 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC39.11■■■■□ 3.85
NOS1P29475 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC39.11■■■■□ 3.85
NOS1P29475 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
NOS1P29475 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
NOS1P29475 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.85
NOS1P29475 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
NOS1P29475 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC39.06■■■■□ 3.84
NOS1P29475 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
NOS1P29475 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.05■■■■□ 3.84
NOS1P29475 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
NOS1P29475 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
NOS1P29475 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
NOS1P29475 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC39.04■■■■□ 3.84
NOS1P29475 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
NOS1P29475 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
NOS1P29475 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
NOS1P29475 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
NOS1P29475 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC39.02■■■■□ 3.84
NOS1P29475 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
NOS1P29475 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
NOS1P29475 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
NOS1P29475 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
NOS1P29475 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
NOS1P29475 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
NOS1P29475 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
NOS1P29475 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
NOS1P29475 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
NOS1P29475 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
NOS1P29475 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
NOS1P29475 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
NOS1P29475 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
NOS1P29475 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
NOS1P29475 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
NOS1P29475 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
NOS1P29475 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
NOS1P29475 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
NOS1P29475 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
NOS1P29475 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
NOS1P29475 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
NOS1P29475 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
NOS1P29475 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms