Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMB5P28074 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMB5P28074 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMB5P28074 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMB5P28074 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMB5P28074 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSMB5P28074 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMB5P28074 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMB5P28074 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMB5P28074 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMB5P28074 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMB5P28074 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PSMB5P28074 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMB5P28074 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMB5P28074 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMB5P28074 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSMB5P28074 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSMB5P28074 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSMB5P28074 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSMB5P28074 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSMB5P28074 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMB5P28074 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMB5P28074 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMB5P28074 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMB5P28074 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMB5P28074 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMB5P28074 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSMB5P28074 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PSMB5P28074 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PSMB5P28074 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSMB5P28074 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSMB5P28074 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PSMB5P28074 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSMB5P28074 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSMB5P28074 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSMB5P28074 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSMB5P28074 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSMB5P28074 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSMB5P28074 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSMB5P28074 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PSMB5P28074 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSMB5P28074 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSMB5P28074 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSMB5P28074 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSMB5P28074 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSMB5P28074 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSMB5P28074 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSMB5P28074 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSMB5P28074 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSMB5P28074 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSMB5P28074 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PSMB5P28074 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PSMB5P28074 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSMB5P28074 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PSMB5P28074 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSMB5P28074 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSMB5P28074 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSMB5P28074 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSMB5P28074 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSMB5P28074 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSMB5P28074 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSMB5P28074 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSMB5P28074 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSMB5P28074 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSMB5P28074 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSMB5P28074 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSMB5P28074 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSMB5P28074 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSMB5P28074 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSMB5P28074 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSMB5P28074 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSMB5P28074 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSMB5P28074 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSMB5P28074 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSMB5P28074 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PSMB5P28074 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSMB5P28074 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSMB5P28074 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSMB5P28074 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PSMB5P28074 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMB5P28074 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMB5P28074 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMB5P28074 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMB5P28074 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMB5P28074 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMB5P28074 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMB5P28074 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMB5P28074 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMB5P28074 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMB5P28074 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMB5P28074 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSMB5P28074 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSMB5P28074 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSMB5P28074 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMB5P28074 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMB5P28074 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMB5P28074 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMB5P28074 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMB5P28074 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMB5P28074 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms