Protein–RNA interactions for Protein: P26640

VARS, Valine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARSP26640 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VARSP26640 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VARSP26640 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VARSP26640 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VARSP26640 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VARSP26640 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VARSP26640 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VARSP26640 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VARSP26640 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VARSP26640 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VARSP26640 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VARSP26640 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VARSP26640 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VARSP26640 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VARSP26640 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VARSP26640 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VARSP26640 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VARSP26640 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VARSP26640 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
VARSP26640 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VARSP26640 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VARSP26640 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VARSP26640 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VARSP26640 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VARSP26640 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VARSP26640 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VARSP26640 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
VARSP26640 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VARSP26640 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VARSP26640 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VARSP26640 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VARSP26640 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VARSP26640 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
VARSP26640 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VARSP26640 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
VARSP26640 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VARSP26640 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VARSP26640 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VARSP26640 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VARSP26640 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VARSP26640 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VARSP26640 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VARSP26640 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VARSP26640 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
VARSP26640 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VARSP26640 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VARSP26640 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VARSP26640 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VARSP26640 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VARSP26640 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VARSP26640 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VARSP26640 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VARSP26640 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VARSP26640 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VARSP26640 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VARSP26640 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VARSP26640 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VARSP26640 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VARSP26640 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VARSP26640 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VARSP26640 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VARSP26640 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VARSP26640 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VARSP26640 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VARSP26640 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VARSP26640 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VARSP26640 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VARSP26640 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VARSP26640 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VARSP26640 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VARSP26640 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VARSP26640 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VARSP26640 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VARSP26640 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VARSP26640 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VARSP26640 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VARSP26640 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VARSP26640 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VARSP26640 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VARSP26640 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VARSP26640 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VARSP26640 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VARSP26640 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VARSP26640 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VARSP26640 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VARSP26640 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VARSP26640 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VARSP26640 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VARSP26640 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VARSP26640 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
VARSP26640 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VARSP26640 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
VARSP26640 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VARSP26640 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VARSP26640 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VARSP26640 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VARSP26640 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
VARSP26640 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VARSP26640 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VARSP26640 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms