Protein–RNA interactions for Protein: P26367

PAX6, Paired box protein Pax-6, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX6P26367 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAX6P26367 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAX6P26367 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAX6P26367 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PAX6P26367 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAX6P26367 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAX6P26367 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAX6P26367 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAX6P26367 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAX6P26367 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAX6P26367 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAX6P26367 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAX6P26367 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAX6P26367 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAX6P26367 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAX6P26367 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAX6P26367 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAX6P26367 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAX6P26367 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAX6P26367 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAX6P26367 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAX6P26367 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAX6P26367 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAX6P26367 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAX6P26367 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAX6P26367 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PAX6P26367 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAX6P26367 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAX6P26367 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAX6P26367 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAX6P26367 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PAX6P26367 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAX6P26367 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAX6P26367 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAX6P26367 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAX6P26367 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAX6P26367 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAX6P26367 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAX6P26367 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PAX6P26367 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PAX6P26367 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAX6P26367 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAX6P26367 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PAX6P26367 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAX6P26367 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAX6P26367 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAX6P26367 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAX6P26367 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAX6P26367 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAX6P26367 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAX6P26367 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAX6P26367 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAX6P26367 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAX6P26367 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAX6P26367 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PAX6P26367 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAX6P26367 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAX6P26367 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAX6P26367 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAX6P26367 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAX6P26367 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PAX6P26367 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PAX6P26367 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PAX6P26367 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PAX6P26367 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PAX6P26367 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PAX6P26367 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PAX6P26367 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PAX6P26367 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAX6P26367 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAX6P26367 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAX6P26367 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAX6P26367 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAX6P26367 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAX6P26367 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAX6P26367 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAX6P26367 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PAX6P26367 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAX6P26367 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAX6P26367 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PAX6P26367 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PAX6P26367 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAX6P26367 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAX6P26367 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAX6P26367 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAX6P26367 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAX6P26367 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAX6P26367 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAX6P26367 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAX6P26367 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAX6P26367 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAX6P26367 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAX6P26367 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAX6P26367 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAX6P26367 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAX6P26367 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAX6P26367 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAX6P26367 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAX6P26367 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAX6P26367 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms