Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CTNNA2P26232 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CTNNA2P26232 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
CTNNA2P26232 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
CTNNA2P26232 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CTNNA2P26232 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CTNNA2P26232 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CTNNA2P26232 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CTNNA2P26232 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTNNA2P26232 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTNNA2P26232 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTNNA2P26232 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTNNA2P26232 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CTNNA2P26232 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CTNNA2P26232 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTNNA2P26232 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CTNNA2P26232 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CTNNA2P26232 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CTNNA2P26232 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CTNNA2P26232 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CTNNA2P26232 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CTNNA2P26232 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CTNNA2P26232 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTNNA2P26232 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CTNNA2P26232 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CTNNA2P26232 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CTNNA2P26232 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CTNNA2P26232 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CTNNA2P26232 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTNNA2P26232 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTNNA2P26232 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CTNNA2P26232 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTNNA2P26232 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTNNA2P26232 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTNNA2P26232 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CTNNA2P26232 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CTNNA2P26232 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CTNNA2P26232 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTNNA2P26232 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTNNA2P26232 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTNNA2P26232 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTNNA2P26232 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTNNA2P26232 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTNNA2P26232 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTNNA2P26232 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTNNA2P26232 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CTNNA2P26232 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTNNA2P26232 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTNNA2P26232 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTNNA2P26232 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CTNNA2P26232 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
CTNNA2P26232 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTNNA2P26232 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTNNA2P26232 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTNNA2P26232 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTNNA2P26232 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTNNA2P26232 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTNNA2P26232 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTNNA2P26232 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTNNA2P26232 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTNNA2P26232 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTNNA2P26232 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTNNA2P26232 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTNNA2P26232 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTNNA2P26232 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTNNA2P26232 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTNNA2P26232 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTNNA2P26232 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTNNA2P26232 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTNNA2P26232 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTNNA2P26232 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CTNNA2P26232 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CTNNA2P26232 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTNNA2P26232 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTNNA2P26232 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTNNA2P26232 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTNNA2P26232 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTNNA2P26232 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTNNA2P26232 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTNNA2P26232 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTNNA2P26232 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTNNA2P26232 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTNNA2P26232 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTNNA2P26232 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTNNA2P26232 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTNNA2P26232 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTNNA2P26232 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CTNNA2P26232 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CTNNA2P26232 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CTNNA2P26232 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTNNA2P26232 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTNNA2P26232 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTNNA2P26232 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTNNA2P26232 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTNNA2P26232 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTNNA2P26232 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTNNA2P26232 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTNNA2P26232 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTNNA2P26232 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTNNA2P26232 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms