Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTAFRP25105 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTAFRP25105 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTAFRP25105 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTAFRP25105 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTAFRP25105 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTAFRP25105 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTAFRP25105 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTAFRP25105 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTAFRP25105 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTAFRP25105 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTAFRP25105 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTAFRP25105 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTAFRP25105 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTAFRP25105 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTAFRP25105 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTAFRP25105 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTAFRP25105 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTAFRP25105 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTAFRP25105 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTAFRP25105 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTAFRP25105 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTAFRP25105 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PTAFRP25105 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTAFRP25105 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTAFRP25105 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTAFRP25105 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTAFRP25105 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTAFRP25105 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTAFRP25105 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTAFRP25105 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTAFRP25105 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTAFRP25105 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTAFRP25105 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTAFRP25105 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTAFRP25105 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTAFRP25105 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTAFRP25105 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTAFRP25105 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTAFRP25105 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTAFRP25105 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTAFRP25105 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTAFRP25105 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTAFRP25105 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTAFRP25105 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTAFRP25105 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTAFRP25105 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTAFRP25105 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTAFRP25105 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTAFRP25105 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTAFRP25105 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTAFRP25105 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTAFRP25105 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTAFRP25105 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTAFRP25105 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTAFRP25105 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTAFRP25105 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTAFRP25105 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTAFRP25105 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTAFRP25105 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTAFRP25105 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTAFRP25105 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTAFRP25105 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTAFRP25105 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTAFRP25105 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTAFRP25105 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTAFRP25105 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTAFRP25105 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTAFRP25105 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTAFRP25105 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTAFRP25105 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTAFRP25105 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTAFRP25105 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTAFRP25105 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTAFRP25105 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTAFRP25105 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTAFRP25105 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTAFRP25105 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTAFRP25105 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTAFRP25105 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTAFRP25105 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
PTAFRP25105 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PTAFRP25105 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PTAFRP25105 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTAFRP25105 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PTAFRP25105 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTAFRP25105 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTAFRP25105 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTAFRP25105 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTAFRP25105 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTAFRP25105 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTAFRP25105 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTAFRP25105 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTAFRP25105 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTAFRP25105 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTAFRP25105 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PTAFRP25105 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTAFRP25105 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTAFRP25105 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PTAFRP25105 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms