Protein–RNA interactions for Protein: P25067

COL8A2, Collagen alpha-2(VIII) chain, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL8A2P25067 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL8A2P25067 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL8A2P25067 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL8A2P25067 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL8A2P25067 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL8A2P25067 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL8A2P25067 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL8A2P25067 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL8A2P25067 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL8A2P25067 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL8A2P25067 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL8A2P25067 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
COL8A2P25067 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL8A2P25067 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL8A2P25067 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL8A2P25067 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL8A2P25067 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL8A2P25067 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL8A2P25067 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL8A2P25067 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL8A2P25067 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL8A2P25067 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL8A2P25067 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL8A2P25067 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL8A2P25067 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL8A2P25067 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL8A2P25067 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL8A2P25067 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL8A2P25067 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL8A2P25067 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL8A2P25067 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL8A2P25067 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL8A2P25067 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL8A2P25067 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL8A2P25067 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL8A2P25067 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL8A2P25067 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL8A2P25067 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL8A2P25067 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL8A2P25067 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL8A2P25067 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
COL8A2P25067 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL8A2P25067 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL8A2P25067 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL8A2P25067 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL8A2P25067 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL8A2P25067 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL8A2P25067 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL8A2P25067 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL8A2P25067 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL8A2P25067 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
COL8A2P25067 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL8A2P25067 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL8A2P25067 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
COL8A2P25067 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL8A2P25067 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
COL8A2P25067 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL8A2P25067 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL8A2P25067 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL8A2P25067 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL8A2P25067 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL8A2P25067 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COL8A2P25067 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
COL8A2P25067 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL8A2P25067 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL8A2P25067 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL8A2P25067 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL8A2P25067 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL8A2P25067 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL8A2P25067 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
COL8A2P25067 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL8A2P25067 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL8A2P25067 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL8A2P25067 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL8A2P25067 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL8A2P25067 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL8A2P25067 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL8A2P25067 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL8A2P25067 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL8A2P25067 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL8A2P25067 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL8A2P25067 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL8A2P25067 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL8A2P25067 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
COL8A2P25067 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL8A2P25067 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL8A2P25067 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL8A2P25067 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL8A2P25067 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL8A2P25067 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL8A2P25067 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL8A2P25067 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL8A2P25067 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL8A2P25067 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL8A2P25067 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL8A2P25067 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL8A2P25067 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL8A2P25067 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL8A2P25067 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL8A2P25067 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms