Protein–RNA interactions for Protein: P24347

MMP11, Stromelysin-3, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP11P24347 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MMP11P24347 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MMP11P24347 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMP11P24347 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MMP11P24347 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MMP11P24347 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MMP11P24347 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP11P24347 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMP11P24347 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMP11P24347 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMP11P24347 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMP11P24347 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMP11P24347 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP11P24347 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP11P24347 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP11P24347 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP11P24347 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP11P24347 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP11P24347 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP11P24347 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP11P24347 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMP11P24347 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMP11P24347 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMP11P24347 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MMP11P24347 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MMP11P24347 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMP11P24347 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MMP11P24347 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMP11P24347 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMP11P24347 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMP11P24347 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMP11P24347 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMP11P24347 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MMP11P24347 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP11P24347 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP11P24347 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MMP11P24347 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MMP11P24347 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MMP11P24347 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MMP11P24347 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MMP11P24347 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MMP11P24347 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MMP11P24347 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMP11P24347 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMP11P24347 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMP11P24347 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMP11P24347 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMP11P24347 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMP11P24347 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMP11P24347 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MMP11P24347 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MMP11P24347 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MMP11P24347 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MMP11P24347 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMP11P24347 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMP11P24347 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMP11P24347 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MMP11P24347 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MMP11P24347 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MMP11P24347 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MMP11P24347 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MMP11P24347 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MMP11P24347 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MMP11P24347 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MMP11P24347 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MMP11P24347 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MMP11P24347 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MMP11P24347 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MMP11P24347 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MMP11P24347 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MMP11P24347 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MMP11P24347 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MMP11P24347 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MMP11P24347 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MMP11P24347 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MMP11P24347 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MMP11P24347 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MMP11P24347 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MMP11P24347 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMP11P24347 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMP11P24347 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MMP11P24347 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMP11P24347 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMP11P24347 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMP11P24347 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMP11P24347 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMP11P24347 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MMP11P24347 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MMP11P24347 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MMP11P24347 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MMP11P24347 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MMP11P24347 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MMP11P24347 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MMP11P24347 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MMP11P24347 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MMP11P24347 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MMP11P24347 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MMP11P24347 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MMP11P24347 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MMP11P24347 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms