Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRDP23468 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRDP23468 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRDP23468 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRDP23468 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRDP23468 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRDP23468 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRDP23468 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRDP23468 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRDP23468 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRDP23468 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRDP23468 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPRDP23468 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPRDP23468 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPRDP23468 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPRDP23468 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRDP23468 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRDP23468 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRDP23468 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRDP23468 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRDP23468 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRDP23468 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRDP23468 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRDP23468 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRDP23468 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRDP23468 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRDP23468 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRDP23468 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRDP23468 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRDP23468 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRDP23468 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PTPRDP23468 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PTPRDP23468 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRDP23468 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRDP23468 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRDP23468 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRDP23468 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRDP23468 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRDP23468 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRDP23468 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRDP23468 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRDP23468 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRDP23468 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRDP23468 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRDP23468 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRDP23468 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRDP23468 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRDP23468 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRDP23468 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRDP23468 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRDP23468 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRDP23468 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRDP23468 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRDP23468 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPRDP23468 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRDP23468 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRDP23468 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRDP23468 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRDP23468 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRDP23468 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRDP23468 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRDP23468 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRDP23468 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRDP23468 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRDP23468 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRDP23468 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRDP23468 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRDP23468 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PTPRDP23468 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRDP23468 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRDP23468 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRDP23468 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRDP23468 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRDP23468 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRDP23468 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRDP23468 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRDP23468 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPRDP23468 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRDP23468 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRDP23468 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRDP23468 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRDP23468 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTPRDP23468 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTPRDP23468 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTPRDP23468 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRDP23468 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRDP23468 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRDP23468 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRDP23468 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRDP23468 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRDP23468 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRDP23468 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRDP23468 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRDP23468 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRDP23468 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRDP23468 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRDP23468 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRDP23468 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRDP23468 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRDP23468 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
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